クラスカル・ウォリスのポストホックの警告メッセージ「関係が存在します」を理解する


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Kruskal-Wallis検定の後で事後比較を実行しています。PMCMRパッケージを使用してます。

> posthoc.kruskal.nemenyi.test( preference ~ instrument)

    Pairwise comparisons using Tukey and Kramer (Nemenyi) test  
                   with Tukey-Dist approximation for independent samples 

data:  preference by instrument 

       Cello Drums Guitar
Drums  0.157 -     -     
Guitar 0.400 0.953 -     
Harp   0.013 0.783 0.458 

P value adjustment method: none 

Warning message:
In posthoc.kruskal.nemenyi.test.default(c(50L, 50L, 50L, 50L, 49L,  :
  Ties are present, p-values are not corrected.

警告メッセージに戸惑いました。誰かがそれが何を意味し、どうすればそれを修正できるか説明できますか?


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実行中に同じ警告が発生しましたposthoc.kruskal.nemenyi.test()。私はデータを実行して絆を調整するように、のx、ties.method =「平均」)posthoc.kruskal.nemenyi.test(データ実行する前に、再y)を、私はまだに関する同じ警告を得ました」ネクタイが存在します。」それは一般的な問題ですか、それともこの問題は私のデータに由来していますか?x d a t ax<rank(datax data
Constanze

回答:


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タイとは、複数の観測値が同じ値を共有していることを意味します(したがって、同じランクです)。例えば、試料は、観察から成る:。「」と「」は2つの関係ですは複製、は複製があります。このようなサンプルは、ランク統計に対応しています:。3 10 3 2 10 3 1 2 2 4 5 5 51,3,3,5,10,10,10310321031,2,2,4,5,5,5

ネクタイが存在する場合、通常はそれを解除する必要があります(そうでない場合は、おそらく表示したとおりに警告メッセージが表示されます)。そして、従来は、元の観測値の関係を壊すのとは対照的に、ランク統計の関係を壊しています。クラスカル・ウォリス検定はランク統計を使用しているため、ランク統計に範囲を制限して質問に答えるだけで十分です。

2,2{2,3}101,3,2,4,6,5,7、したがって、関係が壊れました。この方法の欠点は、タイブレークがランダムであるため、異なる分析間で異なるテスト統計が得られる可能性があることです。

1,2.5,2.5,4,6,6,6

ソフトウェアでは、関数のドキュメントを参照する必要があるタイブレイクオプションを指定できます。

この問題に関する同様の議論については、Rのランク関数のties.method引数はどのように機能するかを参照してください

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