検閲済みデータのJAGSでdinterval()がどのように機能するかを理解しようとしています。粗いデータをモデリングしていますが、各データポイントの上限と下限しかありません(真の値ではありません)。これが私がそれがうまくいくべきだと思う方法の簡単な例です:
各ポイントの上限と下限:
> head(lim)
L U
[1,] 14.98266 15.68029
[2,] 21.21827 21.91590
[3,] 18.34953 19.04716
[4,] 19.00186 19.69949
[5,] 15.39891 16.09654
[6,] 17.81705 18.51468
モデルを作成するための関数(データが共通の平均と分散を持つ法線からのものであると想定):
playmodel <- function(){
for (i in 1:50){
is.censored[i] ~ dinterval(t[i], lim[i,])
t[i] ~ dnorm(mu,tau)
}
mu ~ dnorm(0,.001)
tau ~ dgamma(.01,.01)
}
filename <- "toymod.bug"
write.model(toymod,filename)
jags呼び出しのいくつかの関数と割り当て:
data <- list("lim"=lim)
inits <- list(mu=rnorm(1),tau=rgamma(1,.01,.01),t=as.vector(apply(lim,1,mean)))
#last part is to ensure the starting value is between the upper and lower limit
#each chain will start at the same place for t but this is just for this case
params <- c("mu","tau")
そしてモデルを実行します:
playmodel.jags <- jags(data,inits, params, model.file="toymod.bug", n.chains=3,
n.iter=50000,n.burnin=30000, n.thin=1, DIC=TRUE,
working.directory=NULL,refresh = 50000/50, progress.bar = "text")
これを実行するとどうなりますか?
1)muの私の推定値は、15になるはずの0付近にあります
2)DIC = TRUEの場合は実行されません。
エラー:「jags.samples(model、variable.names、n.iter、thin、type = "trace"のエラー」:ノード逸脱のトレースモニターを設定できませんでした
注:OpenBUGSで同様のモデルを実行するには、dinterval()行を省略し、I(Lower、Upper)をdnormに追加します。