多くのグループとの複数の比較


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複数の比較テストを使用することが私のデータに適しているかどうかを判断したいと思います。クラスカルウォリス検定を使用して、異なるグループ間で平均阻害に差があるかどうかを判断しました。分析の結果、有意差があることがわかりました。次に、多重比較手順(おそらく、サンプルサイズが異なるのでDunnのもの)を使用して、他のグループと異なるグループを確認します。17

私は多くのグループ()を持っているので、これは多重比較テストの能力がほとんどないか、このデータセットに対して実行するのに適切ではないのかと思っていました。k=17


@Alexisの答えは+1ですが、実際に、17のグループのすべてのペアごとの組み合わせをテストする必要があるかどうかを自問する必要があります。136の比較で何をしますか?それらすべてを論文に記載しますか?
amoeba

@amoebaはコミュニケーションに関して優れた点を提起しています。17グループはコミュニケーション可能な結果の境界に近いと思います。そうは言っても、私の引用したソフトウェアを見てください。このような結果を正確に表にまとめる2つの出力形式があります。
Alexis

回答:


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いい質問だ!まず、いくつかの潜在的な混乱を片付けましょう。Dunnの検定(Dunn、1964)は正確に次のとおりです。ペアワイズt検定のノンパラメトリックアナログである検定統計量は、ANOVAに対して事後的に実施されます。これは、マン・ホイットニー・ウィルコクソン順位和検定に似ていますが、(1)クラスカル・ウォリス検定の帰無仮説によって暗示されるプールされた分散の測度を使用し、(2)同じランキングを使用します。クラスカル・ウォリス検定で使用される元のデータの

Dunnは、多重比較の一般的なBonferroni調整(Dunn、1961)と呼ばれるものも開発しました。これは、以来開発されてきた家族単位の誤り率(FWER)を制御する多くの方法の1つであり、単純に(片側検定)または(両側検定)のペアごとの比較の数による。変数を使用して実行できるペアワイズ比較の最大数は。つまり、17 * 16/2 = 136のペアワイズ比較が可能であり、単一のテストの帰無仮説を棄却できる可能性があります。場合。についてのあなたの懸念αα/2kkk1/2pα/2/136 したがって、この方法では保証されます。

ただし、FWERを制御する他の方法は、統計的検出力が高くなります。たとえば、HolmおよびHolm-Sidakのステップワイズ法(Holm、1979)は、Bonferroni法のように出血力はありません。そこでも、代わりに偽発見率(FDR)を制御することを目的とすることができます。これらの方法(Benjamini-Hochberg(1995)およびBenjamini-Yekutieli(2001))は、一般に、いくつかの帰無仮説偽であると仮定することにより、統計的検出力を高めます(つまり、すべての拒否が誤った拒否ではないという考えを、順次変更される拒否基準に組み込むことによって)。これらおよび他の複数の比較調整は、ダンタのテストのためにdunntestパッケージ(スタタタイプ内)のスタタで具体的に実装されてますnet describe dunntest, from(https://alexisdinno.com/stata))、およびdunn.testパッケージのR内。

加えて、そこに(近似に基づくものであるDunnの検定に対する代替であるZの検定統計):コノバー-イマン(排他的に)事後に基づいて拒否クラスカル・ワリス検定に(Tの分布は、どのですダンのテストよりも強力です; Conover&Iman、1979; Convover、1999)。メソッドを使用して、Conovertestパッケージ(Stataタイプ内)のStata net describe conovertest, from(https://alexisdinno.com/stata)conover.testパッケージのRに実装されているConover-ImanテストでFWERまたはFDRを制御することもできます。

参考文献

Benjamini、Y.およびHochberg、Y.(1995)。誤検出率の制御:複数のテストへの実用的で強力なアプローチ王立統計学会誌。シリーズB(方法論)、57(1):289–300。

Benjamini、Y.およびYekutieli、D.(2001)。依存性の下での複数のテストにおける誤った発見率の制御Annals of Statistics、29(4):1165–1188。

Conover、WJ(1999)。実用的なノンパラメトリック統計。ワイリー、ホーボーケン、ニュージャージー州、第3版。

Conover、WJおよびIman、RL(1979)。多重比較手順について。テクニカルレポートLA-7677-MS、ロスアラモス科学研究所。

ダン、OJ(1961)。平均間の複数の比較Journal of the American Statistical Association、56(293):52–64。

ダン、OJ(1964)。ランク合計を使用した多重比較テクノメトリックス、6(3):241–252。

Holm、S.(1979)。単純な連続的拒絶反応の複数のテスト手順統計の北欧ジャーナル、6(65-70):1979。

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