ggplot2を使用して2つのデータセットをQQプロットと比較する方法は?


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統計とRの初心者の両方として、私は1:1のアスペクト比でqqplotを生成しようとするのに本当に苦労しています。ggplot2は、デフォルトのRプロットパッケージよりもはるかに多くのコントロールを提供しているようですが、2つのデータセットを比較するためにggplot2でqqplotを実行する方法がわかりません。

だから私の質問、ggplot2の同等のものは何ですか?

qqplot(datset1,dataset2)

ggplot2のドキュメントが役立つかもしれません:docs.ggplot2.org/current/stat_qq.html
チャーリー

回答:


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最も簡単な方法は、qqplot動作を確認することです。したがって、Rタイプでは:

R> qqplot
function (x, y, plot.it = TRUE, xlab = deparse(substitute(x)), 
    ylab = deparse(substitute(y)), ...) 
{
    sx <- sort(x)
    sy <- sort(y)
    lenx <- length(sx)
    leny <- length(sy)
    if (leny < lenx) 
        sx <- approx(1L:lenx, sx, n = leny)$y
    if (leny > lenx) 
        sy <- approx(1L:leny, sy, n = lenx)$y
    if (plot.it) 
        plot(sx, sy, xlab = xlab, ylab = ylab, ...)
    invisible(list(x = sx, y = sy))
}
<environment: namespace:stats>

したがって、プロットを生成するには、sxとを取得する必要がありますsy。つまり、

x <- rnorm(10);y <- rnorm(20)

sx <- sort(x); sy <- sort(y)
lenx <- length(sx)
leny <- length(sy)
if (leny < lenx)sx <- approx(1L:lenx, sx, n = leny)$y
if (leny > lenx)sy <- approx(1L:leny, sy, n = lenx)$y

require(ggplot2)
g = ggplot() + geom_point(aes(x=sx, y=sy))
g

ggplot2を使用したqqplot


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ggplot2持っていないstat_qq()、それを使用するためのいくつかの方法がありますか?1つのベクトルを理論上の分布と比較するように設計されているようですが、2つの異なるベクトルを比較する方法を確認できませんでした。
ケンウィリアムズ

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あなたが実際に取得することができqqplot()、すべてやってsort/ length/ approxあなたのための計算を: d <- as.data.frame(qqplot(x, y, plot.it=FALSE)); ggplot(d) + geom_point(aes(x=x, y=y))
ケン・ウィリアムズ

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通常のラインも欲しいときに使います。

ggplot(data, aes(sample = data$column1)) + stat_qq(color="firebrick2", alpha=1) + geom_abline(intercept = mean(data$column1), slope = sd(data$column1))


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元のニーズがアスペクト比を制御することだけである場合、これを行う1つの方法は次のとおりです。

x <- rnorm(1000)
y <- rnorm(1500, 2)

myqq <- function(x, y, ...) {
  rg <- range(x, y, na.rm=T)
  qqplot(x, y, xlim=rg, ylim=rg, ...)
}

myqq(x, y)

myqqプロット

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