Rを使用して「並列セット」プロットを作成することはできますか?


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Tormodの質問(ここに投稿)のおかげで、Parallel Setsプロットに出会いました。ここに画像の説明を入力してください これは、どのように見えるかの例です:( タイタニックデータセットの視覚化です。たとえば、生き残っていない女性のほとんどが3番目のクラスに属していたことを示しています...)

Rでそのようなプロットを再現できるようになりたいです。それは可能ですか?

ありがとう、タル


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グラフィックのアイデアについては、Rグラフギャラリーを常に確認します。ここに、あなたが求めているものにいくらか似ているものがあります:R Graph Gallery parallel。タグクラウドで並列をクリックして見つけましたが、より良いオプションがあるかもしれません。
ニックサブベ

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ニック、ありがとう。しかし、これは、コードを大幅に調整しない限り、カテゴリデータでは機能しません(おそらく、これを構築するのに最適な関数のベースではないでしょう)。私は...誰かがすでに似た何かを行っているかもしれません願っています
タルGalili

回答:


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Hadleyのコメントのおかげで、ここにベースグラフィックのみを使用したバージョンがあります。(以前のバージョンについては、編集履歴を参照してください)。

三回目

parallelset <- function(..., freq, col="gray", border=0, layer, 
                             alpha=0.5, gap.width=0.05) {
  p <- data.frame(..., freq, col, border, alpha, stringsAsFactors=FALSE)
  n <- nrow(p)
  if(missing(layer)) { layer <- 1:n }
  p$layer <- layer
  np <- ncol(p) - 5
  d <- p[ , 1:np, drop=FALSE]
  p <- p[ , -c(1:np), drop=FALSE]
  p$freq <- with(p, freq/sum(freq))
  col <- col2rgb(p$col, alpha=TRUE)
  if(!identical(alpha, FALSE)) { col["alpha", ] <- p$alpha*256 }
  p$col <- apply(col, 2, function(x) do.call(rgb, c(as.list(x), maxColorValue = 256)))
  getp <- function(i, d, f, w=gap.width) {
    a <- c(i, (1:ncol(d))[-i])
    o <- do.call(order, d[a])
    x <- c(0, cumsum(f[o])) * (1-w)
    x <- cbind(x[-length(x)], x[-1])
    gap <- cumsum( c(0L, diff(as.numeric(d[o,i])) != 0) )
    gap <- gap / max(gap) * w
    (x + gap)[order(o),]
  }
  dd <- lapply(seq_along(d), getp, d=d, f=p$freq)
  par(mar = c(0, 0, 2, 0) + 0.1, xpd=TRUE )
  plot(NULL, type="n",xlim=c(0, 1), ylim=c(np, 1),
       xaxt="n", yaxt="n", xaxs="i", yaxs="i", xlab='', ylab='', frame=FALSE)
  for(i in rev(order(p$layer)) ) {
     for(j in 1:(np-1) )
     polygon(c(dd[[j]][i,], rev(dd[[j+1]][i,])), c(j, j, j+1, j+1),
             col=p$col[i], border=p$border[i])
   }
   text(0, seq_along(dd), labels=names(d), adj=c(0,-2), font=2)
   for(j in seq_along(dd)) {
     ax <- lapply(split(dd[[j]], d[,j]), range)
     for(k in seq_along(ax)) {
       lines(ax[[k]], c(j, j))
       text(ax[[k]][1], j, labels=names(ax)[k], adj=c(0, -0.25))
     }
   }           
}

data(Titanic)
myt <- subset(as.data.frame(Titanic), Age=="Adult", 
              select=c("Survived","Sex","Class","Freq"))
myt <- within(myt, {
  Survived <- factor(Survived, levels=c("Yes","No"))
  levels(Class) <- c(paste(c("First", "Second", "Third"), "Class"), "Crew")
  color <- ifelse(Survived=="Yes","#008888","#330066")
})

with(myt, parallelset(Survived, Sex, Class, freq=Freq, col=color, alpha=0.2))

アーロン、すごい、素晴らしい答え-Vを2回マークできるといいのに。ありがとうございました!
タルガリリ

2
気に入ってくれて嬉しいです。楽しかった。:)唯一のトリッキーな部分は、バーが開始および終了する場所を取得することです(getpサブ関数内にあります)。残りはポリゴンを描くだけです。
アーロン-モニカの復活

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ちょうど別のpanel.text行。編集を参照してください。
アーロン-モニカーを復活

1
基本グラフィックスでも透明化を行うことができます。
ハドリー

2
その通りその通り。私はそれを完全に忘れていました。物事の格子的な方法にとても慣れていました。興味がある人のために、色文字列にさらに数文字を追加します(例:)#FF000080?rgb詳細があります。
アーロン-モニカの復活

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