大腸菌の発生の分析について統計学者はどんな質問をしますか?


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ドイツでの最近の腸内出血大腸菌EHEC)の 流行について聞いたことがあるかもしれません。
統計学者はEHEC分析についてどのような質問をしますか?
私はレポーター/公務員↔非専門家の間のQ + Aについて考えています、教師とエンジニアはディプロム/マスターの学位を持っていますが、せいぜい統計のほんの少しです。

(写真、EHECのさまざまな株を示すEHEC土地の地図、およびさまざまなテストのカバレッジは可能ですか?)

6月20日(月):EHECの発生は、世界全体で統計が本当に重要な領域であると思いました:さまざまな原因の証拠は何ですか、これらをどのように一般に伝えることができますか?それで、賞金を始めます。


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良い回答に対する投票は担当者に数えられるべきだと思うので、コミュニティーwikiであるかどうかはわかりません。そのような場合は、より良い回答が得られる可能性があります。
Jeromy Anglim 2011年

回答:


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f(s)=E(prevalence| you are in location s)。データを過剰に適合させないようにするために、いくつかの平滑化が適切であり、これは効果的に近くの場所を一緒に「ビニング」します。最も簡単な方法は、カーネル密度推定関数を使用することです(たとえば、Rのkde2d関数ですが、データの前処理が必要になる場合があります)。これは、空間分布の「ホットスポット」を特定するのに役立ち、調査員がE. Coliの環境貯水池を特定するのに役立つ可能性があります。

他のデータに応じて、既知の交絡因子を調整するより高度な空間モデルを使用できます。


EHECバリアントとそれらの可能なソースの診断は、難しいと思われます。ご存知のように、ドイツの当局者は最初に「それはスペインからのキュウリだ」と言って、それから数週間後に「それは間違いなく芽です」(種子、水...?)症状がはっきりしている場合、1854年にロンドンで発生しコレラの発生に関する有名な地図のように、地図が原因となる可能性があります。しかし、 EHEC発生マップ
denis
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