RでStataの「堅牢な」オプションを複製する


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robustR のStataオプションの結果を複製しようとしています。MASSパッケージrlmのコマンドlmrobとパッケージ「robustbase」のコマンドを使用しました。どちらの場合も、結果はStataの「堅牢な」オプションとはまったく異なります。誰でもこの文脈で何かを提案できますか?

Stataで堅牢なオプションを実行したときに得られた結果は次のとおりです。

. reg yb7 buildsqb7 no_bed no_bath rain_harv swim_pl pr_terrace, robust

Linear regression                                      Number of obs =    4451
                                                       F(  6,  4444) =  101.12
                                                       Prob > F      =  0.0000
                                                       R-squared     =  0.3682
                                                       Root MSE      =   .5721

------------------------------------------------------------------------------
             |               Robust
         yb7 |      Coef.   Std. Err.      t    P>|t|     [95% Conf. Interval]
-------------+----------------------------------------------------------------
   buildsqb7 |   .0046285   .0026486     1.75   0.081    -.0005639     .009821
      no_bed |   .3633841   .0684804     5.31   0.000     .2291284    .4976398
     no_bath |   .0832654   .0706737     1.18   0.239    -.0552904    .2218211
   rain_harv |   .3337906   .0395113     8.45   0.000     .2563289    .4112524
     swim_pl |   .1627587   .0601765     2.70   0.007     .0447829    .2807346
  pr_terrace |   .0032754   .0178881     0.18   0.855    -.0317941    .0383449
       _cons |   13.68136   .0827174   165.40   0.000     13.51919    13.84353

そして、これは私がRでlmrobオプションで取得したものです:

> modelb7<-lmrob(yb7~Buildsqb7+No_Bed+Rain_Harv+Swim_Pl+Gym+Pr_Terrace, data<-bang7)
> summary(modelb7)

Call:
lmrob(formula = yb7 ~ Buildsqb7 + No_Bed + Rain_Harv + Swim_Pl + Gym + Pr_Terrace, 
    data = data <- bang7)
 \--> method = "MM"
Residuals:
      Min        1Q    Median        3Q       Max 
-51.03802  -0.12240   0.02088   0.18199   8.96699 

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept) 12.648261   0.055078 229.641   <2e-16 ***
Buildsqb7    0.060857   0.002050  29.693   <2e-16 ***
No_Bed       0.005629   0.019797   0.284   0.7762    
Rain_Harv    0.230816   0.018290  12.620   <2e-16 ***
Swim_Pl      0.065199   0.028121   2.319   0.0205 *  
Gym          0.023024   0.014655   1.571   0.1162    
Pr_Terrace   0.015045   0.013951   1.078   0.2809    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1

Robust residual standard error: 0.1678 
Multiple R-squared:  0.8062,    Adjusted R-squared:  0.8059 

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Cross Validatedへようこそ!タイトルをもう少しわかりやすくし、フォーマットを追加しました。一般に、プログラミングの質問はここでは話題になりません、あなたの質問は統計的な問題を伴うからと思います。希望は....あなたの周りを見るために
マット・クラウス

3
少なくともStataとRのモデルを推定するために使用されるコードを貼り付けると、非常に役立ちます(完全に再現可能な例を提供する場合はさらに良いでしょう)。「結果が異なる」と言う場合-同じモデルを推定する場合は、係数推定値ではなく、標準誤差のみが異なる必要があります。
アンディ・W

:大丈夫...これらは私がSTATAで堅牢なオプションによって得られた結果である
user56579

5
lmrob、と同じではないようですreg y x, robust。Googleの「不均一な一貫性のある標準エラーR」。あなたはどのように使用するかを示すページを得るでしょうlmtestし、sandwichライブラリを。
generic_user

3
Stataはn /(nk)の小さなサンプル補正係数を使用します。Rは通常何か他のことをするので、それに合わせて調整してください。
Dimitriy V. Masterov

回答:


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チャールズは彼の答えにほぼありrobustますが、regressStata のコマンド(および他の回帰推定コマンド)のオプションによりcoeftestlmtestパッケージ内の関数のように、複数のタイプの不均一分散および自己相関ロバスト分散共分散行列推定器を使用できますturnはvcovHCsandwichパッケージ内の関数によって生成されるそれぞれの分散共分散行列に依存します。

しかし、2で使用されるデフォルトの分散共分散行列は異なります
によって返さ1.デフォルトの分散共分散行列はvcocHC、いわゆるいるHC3のmanページで説明する理由のためにvcovHC
2. sandwichCharlesがcoeftest使用するオプションは、HC0堅牢な分散共分散行列を使用します。
3. robust呼び出しでオプションを使用するStataのデフォルトの動作を再現するには、堅牢な分散共分散行列の使用regressを要求vcovHCする必要がありますHC1

詳細はこちらをご覧ください

上記のすべてのポイントを示す次の例は、ここの例に基づいています

library(foreign)
library(sandwich)
library(lmtest)

dfAPI = read.dta("http://www.ats.ucla.edu/stat/stata/webbooks/reg/elemapi2.dta")
lmAPI = lm(api00 ~ acs_k3 + acs_46 + full + enroll, data= dfAPI)
summary(lmAPI)                                  # non-robust

# check that "sandwich" returns HC0
coeftest(lmAPI, vcov = sandwich)                # robust; sandwich
coeftest(lmAPI, vcov = vcovHC(lmAPI, "HC0"))    # robust; HC0 

# check that the default robust var-cov matrix is HC3
coeftest(lmAPI, vcov = vcovHC(lmAPI))           # robust; HC3 
coeftest(lmAPI, vcov = vcovHC(lmAPI, "HC3"))    # robust; HC3 (default)

# reproduce the Stata default
coeftest(lmAPI, vcov = vcovHC(lmAPI, "HC1"))    # robust; HC1 (Stata default)

上記のコードの最後の行は、Stataからの結果を再現します。

use http://www.ats.ucla.edu/stat/stata/webbooks/reg/elemapi2
regress api00 acs_k3 acs_46 full enroll, robust

データへのリンクが無効です。リンクを更新してください。これと同じファイル:faculty.smu.edu/tfomby/eco5350/data/Examples/elemapi2.dta
vasili111

信頼区間も再現する方法は?
vasili111


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2018年4月の時点で私はあなたがしたいと考えているestimatrパッケージの代替で近くにあるドロップを提供し、lm。ドキュメントからほぼ引き出されたいくつかの例:

library(estimatr)
library(car)

# HC1 robust standard errors
model <- lm_robust(GPA_year2 ~ gpa0 + ssp, data = alo_star_men,
                   se_type = "stata")
summary(model)
#> 
#> Call:
#> lm_robust(formula = GPA_year2 ~ gpa0 + ssp, data = alo_star_men, 
#>     se_type = "stata")
#> 
#> Standard error type:  HC1 
#> 
#> Coefficients:
#>             Estimate Std. Error  Pr(>|t|) CI Lower CI Upper  DF
#> (Intercept) -3.60625    1.60084 0.0258665 -6.77180  -0.4407 137
#> gpa0         0.06814    0.02024 0.0009868  0.02812   0.1082 137
#> ssp          0.31917    0.18202 0.0817589 -0.04077   0.6791 137
#> 
#> Multiple R-squared:  0.09262 ,   Adjusted R-squared:  0.07937 
#> F-statistic: 6.992 on 2 and 137 DF,  p-value: 0.001284

# HC1 cluster robust standard errors
model2 <- lm_robust(GPA_year2 ~ gpa0 + ssp, cluster = ssp,
                   data = alo_star_men, se_type = "stata")
summary(model2)
#> 
#> Call:
#> lm_robust(formula = GPA_year2 ~ gpa0 + ssp, data = alo_star_men, 
#>     clusters = ssp, se_type = "stata")
#> 
#> Standard error type:  stata 
#> 
#> Coefficients:
#>             Estimate Std. Error Pr(>|t|) CI Lower CI Upper DF
#> (Intercept) -3.60625   1.433195 0.240821 -21.8167  14.6042  1
#> gpa0         0.06814   0.018122 0.165482  -0.1621   0.2984  1
#> ssp          0.31917   0.004768 0.009509   0.2586   0.3798  1
#> 
#> Multiple R-squared:  0.09262 ,   Adjusted R-squared:  0.07937 
#> F-statistic: 6.992 on 2 and 137 DF,  p-value: 0.001284

このcarパッケージにより、これらのモデルのオムニバス仮説テストを簡単に実行できます。

linearHypothesis(model, c("gpa0 = ssp"))
#> Linear hypothesis test
#> 
#> Hypothesis:
#> gpa0 - ssp = 0
#> 
#> Model 1: restricted model
#> Model 2: GPA_year2 ~ gpa0 + ssp
#> 
#>   Res.Df Df  Chisq Pr(>Chisq)
#> 1    138                     
#> 2    137  1 1.8859     0.1697

4

質問を編集します。堅牢な回帰とStataの堅牢なコマンドを混同しています。この混乱を導入してもメリットはないようです。

いくつかのアプローチがあると思います。私はそれらすべてを見たことがなく、どれがベストかわからない:

サンドイッチパッケージ:

library(sandwich)    
coeftest(model, vcov=sandwich)

しかし、これは何らかの理由でStataから得たのと同じ答えを私に与えません。理由を解明しようとしたことはありませんが、上記のコメントに提案された答えがあります-私はこのパッケージを使用していません。

rmsパッケージ:

私はこれを扱うのに少し苦痛を感じますが、通常はいくらかの努力で良い答えを得ます。そして、それは私にとって最も有用です。

model = ols(a~b, x=TRUE)    
robcov(model)

最初からコーディングできます

このブログ投稿(http://thetarzan.wordpress.com/2011/05/28/heteroskedasticity-robust-and-clustered-standard-errors-in-r/)を参照してください。最も痛いオプションのように見えますが、非常に簡単であり、このオプションが最適に機能することがよくあります。


4
チャールズは要点については正しいが、他の場所で暗示されていることを明確にするために、Stataにはrobust命令がないことに注意してください!(_robustここでは直接関係のないプログラマーのコマンドがあります。)むしろ、堅牢な(Huber-Eicker-White-sandwich)標準エラーを取得するために、Stataの最新のアプローチはvce(robust)オプションとして指定することです。robustオプションを指定する古いアプローチは引き続き機能します。より広範には、ロバスト回帰(など)と「ロバスト」SEの違いによって生じる混乱は残念です。
ニックコックス14

ねえ。どうもありがとう。コードは機能し、実際にStataが実行する結果を提供します。質問だけです。ロバスト回帰はロバスト標準エラーとは異なり、データに外れ値が含まれている場合はロバスト回帰が使用されることを理解しています。しかし、不均一分散の問題も解決します。パッケージ "robustbase"の "lmrob"コマンドで提供されるMMの種類の推定を、外れ値と不均一分散の問題の解決策として同時に使用できるかどうかを教えてください。
user56579

@ user56579私の推測では、これについて別の質問をしたいということです。
tchakravarty 14年
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