回答:
あなたがリンクしたまさに記事に見られるように、設定の説明は言います:
NTFSの長いパスを有効にすると、マニフェストされたwin32アプリケーションとWindowsストアアプリケーションが、ノードあたり通常の260文字の制限を超えるパスにアクセスできます。この設定を有効にすると、プロセス内で長いパスにアクセスできるようになります。
つまり、これをオンにした後でも、すべてのアプリケーションが長いパスにアクセスできるようになるわけではありません。このサポートに「オプトイン」するために、特定のアプリケーションをそれぞれコーディングする必要があります。
この記事の執筆時点では、Explorer.exeとcmd.exeはまだこれを利用していません。(しかし、最終的には...ただ時間を与えます。)
しかし、Powershellが新しい機能を利用しているのを見ました: