組み込みプラグインを使用してSLURMを実行しているクラスターの汎用リソースとしてGPUをリクエストすると失敗するのはなぜですか?


10

免責事項:すべての関連する構成情報を提供しようとしたので、この投稿はかなり長くなります。

ステータスと問題:

私はgpuクラスターを管理しており、ジョブ管理にslurmを使用したいと考えています。残念ながら、slurmの各汎用リソースプラグインを使用してGPUをリクエストできません。

注:test.shは、環境変数CUDA_VISIBLE_DEVICESを出力する小さなスクリプトです。

でのジョブの実行--gres=gpu:1は完了しません

実行srun -n1 --gres=gpu:1 test.shすると、次のエラーが発生します。

srun: error: Unable to allocate resources: Requested node configuration is not available

ログ:

gres: gpu state for job 83
    gres_cnt:4 node_cnt:0 type:(null)
    _pick_best_nodes: job 83 never runnable
    _slurm_rpc_allocate_resources: Requested node configuration is not available

でジョブを実行して--gres=gram:500います

srun -n1 --gres=gram:500 test.shしかし、私が呼び出すと、ジョブが実行されて印刷されます

CUDA_VISIBLE_DEVICES=NoDevFiles

ログ:

sched: _slurm_rpc_allocate_resources JobId=76 NodeList=smurf01 usec=193
debug:  Configuration for job 76 complete
debug:  laying out the 1 tasks on 1 hosts smurf01 dist 1
job_complete: JobID=76 State=0x1 NodeCnt=1 WIFEXITED 1 WEXITSTATUS 0
job_complete: JobID=76 State=0x8003 NodeCnt=1 done

したがって、slurmはsrun、要求された汎用リソースを使用してジョブを実行するように正しく構成さ--gresれているようですが、何らかの理由でgpusを認識しません。

私の最初のアイデアは、他の総称リソースが機能しているように見えるので、gpu総称リソースに別の名前を使用することでしたが、私はgpuプラグインに固執したいと思います。

構成

クラスターには3つ以上のスレーブホストがありますが、明確にするために、2つのわずかに異なる構成のスレーブホストとコントローラーホスト、papa(コントローラー)、smurf01、smurf02を使用します。

slurm.conf

スラム構成の一般的なリソース関連部分:

...
TaskPlugin=task/cgroup
...
GresTypes=gpu,ram,gram,scratch
...
NodeName=smurf01 NodeAddr=192.168.1.101 Feature="intel,fermi" Boards=1 SocketsPerBoard=2 CoresPerSocket=6 ThreadsPerCore=2 Gres=gpu:tesla:8,ram:48,gram:no_consume:6000,scratch:1300
NodeName=smurf02 NodeAddr=192.168.1.102 Feature="intel,fermi" Boards=1 SocketsPerBoard=2 CoresPerSocket=6 ThreadsPerCore=1 Gres=gpu:tesla:8,ram:48,gram:no_consume:6000,scratch:1300
...

注:ramはGB単位、gramはMB単位、GBはスクラッチです。

の出力 scontrol show node

NodeName=smurf01 Arch=x86_64 CoresPerSocket=6
   CPUAlloc=0 CPUErr=0 CPUTot=24 CPULoad=0.01 Features=intel,fermi
   Gres=gpu:tesla:8,ram:48,gram:no_consume:6000,scratch:1300
   NodeAddr=192.168.1.101 NodeHostName=smurf01 Version=14.11
   OS=Linux RealMemory=1 AllocMem=0 Sockets=2 Boards=1
   State=IDLE ThreadsPerCore=2 TmpDisk=0 Weight=1
   BootTime=2015-04-23T13:58:15 SlurmdStartTime=2015-04-24T10:30:46
   CurrentWatts=0 LowestJoules=0 ConsumedJoules=0
   ExtSensorsJoules=n/s ExtSensorsWatts=0 ExtSensorsTemp=n/s

NodeName=smurf02 Arch=x86_64 CoresPerSocket=6
   CPUAlloc=0 CPUErr=0 CPUTot=12 CPULoad=0.01 Features=intel,fermi
   Gres=gpu:tesla:8,ram:48,gram:no_consume:6000,scratch:1300
   NodeAddr=192.168.1.102 NodeHostName=smurf02 Version=14.11
   OS=Linux RealMemory=1 AllocMem=0 Sockets=2 Boards=1
   State=IDLE ThreadsPerCore=1 TmpDisk=0 Weight=1
   BootTime=2015-04-23T13:57:56 SlurmdStartTime=2015-04-24T10:24:12
   CurrentWatts=0 LowestJoules=0 ConsumedJoules=0
   ExtSensorsJoules=n/s ExtSensorsWatts=0 ExtSensorsTemp=n/s

smurf01構成

GPU

 > ls /dev | grep nvidia
nvidia0
... 
nvidia7
 > nvidia-smi | grep Tesla
|   0  Tesla M2090         On   | 0000:08:00.0     Off |                    0 |
... 
|   7  Tesla M2090         On   | 0000:1B:00.0     Off |                    0 |
...

gres.conf

Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia0 CPUs=0
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia1 CPUs=1
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia2 CPUs=2
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia3 CPUs=3
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia4 CPUs=4
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia5 CPUs=5
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia6 CPUs=6
Name=gpu Type=tesla File=/dev/nvidia7 CPUs=7
Name=ram Count=48
Name=gram Count=6000
Name=scratch Count=1300

smurf02構成

GPU

smurf01と同じ構成/出力。

smurf02のgres.conf

Name=gpu Count=8 Type=tesla File=/dev/nvidia[0-7]
Name=ram Count=48
Name=gram Count=6000
Name=scratch Count=1300

注:デーモンが再起動され、マシンも再起動されました。slurmとジョブ送信ユーザーは、スレーブノードとコントローラーノードで同じID /グループを持ち、Munge認証は正しく機能しています。

ログ出力

DebugFlags=Gresslurm.confファイルに追加したところ、GPUはプラグインによって認識されているようです。

コントローラーログ

gres / gpu: state for smurf01
   gres_cnt found : 8 configured : 8 avail : 8 alloc : 0
   gres_bit_alloc :
   gres_used : (null)
   topo_cpus_bitmap[0] : 0
   topo_gres_bitmap[0] : 0
   topo_gres_cnt_alloc[0] : 0
   topo_gres_cnt_avail[0] : 1
   type[0] : tesla
   topo_cpus_bitmap[1] : 1
   topo_gres_bitmap[1] : 1
   topo_gres_cnt_alloc[1] : 0
   topo_gres_cnt_avail[1] : 1
   type[1] : tesla
   topo_cpus_bitmap[2] : 2
   topo_gres_bitmap[2] : 2
   topo_gres_cnt_alloc[2] : 0
   topo_gres_cnt_avail[2] : 1
   type[2] : tesla
   topo_cpus_bitmap[3] : 3
   topo_gres_bitmap[3] : 3
   topo_gres_cnt_alloc[3] : 0
   topo_gres_cnt_avail[3] : 1
   type[3] : tesla
   topo_cpus_bitmap[4] : 4
   topo_gres_bitmap[4] : 4
   topo_gres_cnt_alloc[4] : 0
   topo_gres_cnt_avail[4] : 1
   type[4] : tesla
   topo_cpus_bitmap[5] : 5
   topo_gres_bitmap[5] : 5
   topo_gres_cnt_alloc[5] : 0
   topo_gres_cnt_avail[5] : 1
   type[5] : tesla
   topo_cpus_bitmap[6] : 6
   topo_gres_bitmap[6] : 6
   topo_gres_cnt_alloc[6] : 0
   topo_gres_cnt_avail[6] : 1
   type[6] : tesla
   topo_cpus_bitmap[7] : 7
   topo_gres_bitmap[7] : 7
   topo_gres_cnt_alloc[7] : 0
   topo_gres_cnt_avail[7] : 1
   type[7] : tesla
   type_cnt_alloc[0] : 0
   type_cnt_avail[0] : 8
   type[0] : tesla
...
gres/gpu: state for smurf02
   gres_cnt found:TBD configured:8 avail:8 alloc:0
   gres_bit_alloc:
   gres_used:(null)
   type_cnt_alloc[0]:0
   type_cnt_avail[0]:8
   type[0]:tesla

スレーブログ

Gres Name = gpu Type = tesla Count = 8 ID = 7696487 File = / dev / nvidia[0 - 7]
...
gpu 0 is device number 0
gpu 1 is device number 1
gpu 2 is device number 2
gpu 3 is device number 3
gpu 4 is device number 4
gpu 5 is device number 5
gpu 6 is device number 6
gpu 7 is device number 7

リクエストするとどうなります--gres=gpu:tesla:1か?
NNWizard

@NMWizardタイプを指定しない場合と同じです。
Pixchem

回答:


1

インストールされたバージョンのスラム(14.11.5)は、GPUに割り当てられたタイプに問題があるようです。ノード構成行をから削除Type=...し、gres.confそれに応じて(にGres=gpu:N,ram:...)変更すると、を介してgpusを必要とするジョブが正常に実行されるためです--gres=gpu:N

弊社のサイトを使用することにより、あなたは弊社のクッキーポリシーおよびプライバシーポリシーを読み、理解したものとみなされます。
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.