私は分子動力学（MD）シミュレーションが初めてです。シミュレーション時間に関する分子動力学シミュレーションの複雑さは何ですか？言い換えると、シミュレーション時間を10ナノ秒から20ナノ秒に増やしたい場合、ランタイムの増加に関して何が期待できますか？
私は分子動力学（MD）シミュレーションが初めてです。シミュレーション時間に関する分子動力学シミュレーションの複雑さは何ですか？言い換えると、シミュレーション時間を10ナノ秒から20ナノ秒に増やしたい場合、ランタイムの増加に関して何が期待できますか？
回答:
分子動力学シミュレーションは、（線形であるO(n)（単一のタイムステップ（と仮定してシミュレートされた時間の長さ））変化しません）。各タイムステップは前の構成にのみ依存するため（前の構成には依存しないため）、タイムステップの数を増やすと、時間は直線的に増加します。
O(n^2)O(t)場合nサイズは（粒子数）であり、t時間ステップ（各時間ステップのサイズで割ったシミュレート時間の長さ）の数です。