OpenMPなどの共有メモリモードでMPI-3.0を実行する方法

5次元の人口バランスモデルを数値的に解くためにコードを並列化します。現在、FORTRANには非常に優れたMPICH2並列化コードがありますが、パラメーター値を大きくすると、配列が大きくなりすぎて分散メモリモードで実行できなくなります。

15ノードのクラスターにアクセスできます。各ノードには2つの8コアCPUと128GBのRAMがあります。共有メモリモードでMPI-3.0を使用してプログラムを実行し、各プロセスが各アレイの独自のコピーを生成しないようにしたいと思います。

クラスターで何かを実行する前に、Ubuntuを実行しているデスクトップでテストする必要があります。2つの8コアCPUと128 GBのRAMを備えているという点で、本質的にクラスターの1つのブレードです。コードを書いてテストしますので、Ubuntuコンピューターでプログラムを実行するように応答してください。

MPI-3.0をデフォルトの分散メモリモードの代わりにOpenMPのような共有メモリモードで実行する方法があることを読みました。

質問：

1. コードを変更するにはどうすればよいですか？次のような他のMPI関数への呼び出しを追加する必要がありMPI_WIN_ALLOCATEますか？

2. 共有メモリモードでMPI-3.0を実行するようにコードをコンパイルするにはどうすればよいですか？複数のノードにまたがる場合、これは異なりますか？

可能な場合は、サンプルのコンパイルスクリプトを提供してください。また、GNUコンパイラしかありません。私が使用しているクラスターは、Intelコンパイラーをサポートしていません。

Stack Overflowにもこのリンクがあります。私は永遠に私のような質問を探していたと誓いますが、スタックオーバーフローで質問を検索する最良の方法は、質問を開始することであり、同様の投稿を提案します。

とにかく、実際にはopenmpのような共有メモリモードでMPI3.0 +を実行できると言うリンクがあります。私が見つけた他の情報源もありますが、提案できるものもありますが、その方法を説明したり、それを理解するためのリソースを与えたりすることはできません。

/programming/24797298/mpi-fortran-code-how-to-share-data-on-node-via-openmp

このリンクのここに記載されているアドバイスに従った後、USE 'mpi_f08'をコードの先頭に配置することで問題が発生しました。現在、mpi_f08を使用するためのFORTRAN2008サポートが明らかに不足しているgfortran-4.8を使用しています。このリンクには、おそらくintel fortran 2008コンパイラを使用している人がいたでしょう。Fortran2003までをカバーするUSE mpiを使用できます。ただし、Fortran 2003には、MPI_WIN_ALLOCATE_SHAREDなどのリモートメモリアクセス関数を使用するために必要なType（）関数があるとは思わないため、FORTRAN2008なしでは使用できません。しかし、私は実際にそれを確かに言うのに十分なリソースを持っていませんが、私が見つけたものはそれを示唆しています。