Fortranコンパイラは実際にどれほど優れていますか?


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この質問は、「C ++ vs Fortran for HPC」への回答で最近出された2つの議論の延長です。そして、それは質問よりも少し挑戦です...

Fortranを支持する最もよく耳にする引数の1つは、コンパイラーが優れていることです。ほとんどのC / Fortranコンパイラは同じバックエンドを共有するため、両方の言語で意味的に同等のプログラム用に生成されたコードは同一である必要があります。ただし、コンパイラが最適化するのはC / Fortranの方が多かれ少なかれ簡単だと主張することができます。

そこで、簡単なテストを試すことにしました。daxpy.fdaxpy.cのコピーを入手し、gfortran / gccでコンパイルしました。

daxpy.cはdaxpy.fのf2c変換(自動生成コード、見苦しい)なので、そのコードを取り、それを少しクリーンアップしました(daxpy_cに会います)。

for ( i = 0 ; i < n ; i++ )
    dy[i] += da * dx[i];

最後に、gccのベクトル構文を使用して書き直しました(daxpy_cvecと入力します)。

#define vector(elcount, type)  __attribute__((vector_size((elcount)*sizeof(type)))) type
vector(2,double) va = { da , da }, *vx, *vy;

vx = (void *)dx; vy = (void *)dy;
for ( i = 0 ; i < (n/2 & ~1) ; i += 2 ) {
    vy[i] += va * vx[i];
    vy[i+1] += va * vx[i+1];
    }
for ( i = n & ~3 ; i < n ; i++ )
    dy[i] += da * dx[i];

長さ2のベクトル(SSE2で許可されているすべてのベクトル)を使用し、一度に2つのベクトルを処理することに注意してください。これは、多くのアーキテクチャでは、ベクトル要素よりも多くの乗算ユニットを使用できるためです。

すべてのコードは、フラグ「-O3 -Wall -msse2 -march = native -ffast-math -fomit-frame-pointer -malign-double -fstrict-aliasing」を使用してgfortran / gccバージョン4.5を使用してコンパイルされました。私のラップトップ(Intel Core i5 CPU、M560、2.67GHz)では、次の出力が得られました。

pedro@laika:~/work/fvsc$ ./test 1000000 10000
timing 1000000 runs with a vector of length 10000.
daxpy_f took 8156.7 ms.
daxpy_f2c took 10568.1 ms.
daxpy_c took 7912.8 ms.
daxpy_cvec took 5670.8 ms.

したがって、元のFortranコードは8.1秒以上かかり、その自動変換には10.5秒かかります。素朴なC実装では7.9で、明示的にベクトル化されたコードでは5.6でわずかに短縮されます。

Fortranは、単純なC実装よりもわずかに遅く、ベクトル化されたC実装よりも50%遅くなります。

だからここに質問があります:私はネイティブCプログラマーであり、そのコードで良い仕事をしたと確信していますが、Fortranコードは1993年に最後に触れたため、少し古くなっているかもしれません。私はFortranでのコーディングは他の人ほど快適ではないと感じているので、誰かがより良い仕事をすることができますか?つまり、2つのCバージョンのどれよりも競争力がありますか?

また、誰かがこのテストをicc / ifortで試すことはできますか?ベクトル構文はおそらく動作しませんが、素朴なCバージョンがそこでどのように動作するかを知りたいと思います。同じことは、xlc / xlfが横になっている人にも当てはまります。

ここにソースとMakefileをアップロードしまし。正確なタイミングを取得するには、test.cのCPU_TPSをCPUのHz数に設定します。バージョンの改善点を見つけたら、ここに投稿してください!

更新:

オンラインでファイルにstaliのテストコードを追加し、Cバージョンを追加しました。前のテストと一貫性を保つために、長さ10'000のベクトルで1'000'000ループを実行するようにプログラムを変更しました(また、staliのオリジナルのように、マシンが長さ1'000'000'000のベクトルを割り当てることができなかったためコード)。数値が少し小さくなったため、オプションを使用-par-threshold:50して、コンパイラを並列化する可能性を高めました。使用されるicc / ifortバージョンは12.1.2 20111128であり、結果は次のとおりです。

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=1 time ./icctest_c
3.27user 0.00system 0:03.27elapsed 99%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=1 time ./icctest_f
3.29user 0.00system 0:03.29elapsed 99%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=2 time ./icctest_c
4.89user 0.00system 0:02.60elapsed 188%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=2 time ./icctest_f
4.91user 0.00system 0:02.60elapsed 188%CPU

要約すると、結果は、すべての実用的な目的で、CバージョンとFortranバージョンの両方で同一であり、両方のコードが自動的に並列化します。前のテストと比較した高速時間は、単精度浮動小数点演算の使用によるものであることに注意してください!

更新:

私はここで証明の負担がどこに行くのか本当に好きではありませんが、私はCでstaliの行列乗算の例を再コーディングし、それをウェブ上のファイルに追加しました。1つと2つのCPUのトリプルループの結果は次のとおりです。

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=1 time ./mm_test_f 2500
 triple do time   3.46421700000000     
3.63user 0.06system 0:03.70elapsed 99%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=1 time ./mm_test_c 2500
triple do time 3.431997791385768
3.58user 0.10system 0:03.69elapsed 99%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=2 time ./mm_test_f 2500
 triple do time   5.09631900000000     
5.26user 0.06system 0:02.81elapsed 189%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=2 time ./mm_test_c 2500
triple do time 2.298916975280899
4.78user 0.08system 0:02.62elapsed 184%CPU

ことに注意してくださいcpu_timeFortranでCPU時間ではなく、壁時計時間をmeasuersので、私は中のコールを包んだtime2つのCPUのためにそれらを比較します。Cバージョンが2つのコアで少し良くなることを除いて、結果に実際の違いはありません。

matmulこの組み込み関数はCでは使用できないため、コマンドについてはもちろんFortranでのみ使用できます。

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=1 time ./mm_test_f 2500
 matmul    time   23.6494780000000     
23.80user 0.08system 0:23.91elapsed 99%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=2 time ./mm_test_f 2500
 matmul    time   26.6176640000000     
26.75user 0.10system 0:13.62elapsed 197%CPU

ワオ。それは絶対にひどいです。誰かが私が間違っていることを見つけたり、なぜこの組み込み関数がまだなぜ良いことなのかを説明できますか?

dgemmインテルMKLの同じ関数のライブラリー呼び出しであるため、ベンチマークには呼び出しを追加しませんでした。

将来のテストでは、FortranよりもCの方が遅いことが知られている例を提案できますか?

更新

matmul組み込み関数が小さな行列の明示的な行列積よりも「マグニチュード」であるというstaliの主張を検証するために、私は独自のコードを修正し、両方の方法を使用してサイズ100x100の行列をそれぞれ10'000倍に乗算しました。1つと2つのCPUでの結果は次のとおりです。

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=1 time ./mm_test_f 10000 100
 matmul    time   3.61222500000000     
 triple do time   3.54022200000000     
7.15user 0.00system 0:07.16elapsed 99%CPU

pedro@laika:~/work/fvsc$ OMP_NUM_THREADS=2 time ./mm_test_f 10000 100
 matmul    time   4.54428400000000     
 triple do time   4.31626900000000     
8.86user 0.00system 0:04.60elapsed 192%CPU

更新

Grisuは、最適化なしでgccが複素数の演算をライブラリ関数呼び出しに変換し、gfortranがいくつかの命令でインライン化することを指摘しています。

オプション-fcx-limited-rangeが設定されている場合、Cコンパイラは同じコンパクトなコードを生成します。つまり、コンパイラは、中間値の潜在的なオーバーフロー/アンダーフローを無視するように指示されます。このオプションは、gfortranでデフォルトで何らかの形で設定されており、誤った結果になる可能性があります。-fno-cx-limited-rangegfortranの強制は何も変更しませんでした。

したがって、これは実際には数値計算にgfortranを使用することに対する議論です。正しい結果が浮動小数点範囲内にある場合でも、複素数値の演算はオーバーフロー/アンダーフローする可能性があります。これは実際にはFortran標準です。gcc、または一般的なC99では、特に指定がない限り、デフォルトでは厳密に(IEEE-754準拠に準拠して)処理が行われます。

注意: FortranコンパイラーがCコンパイラーよりも優れたコードを生成するかどうかが主要な問題であったことに注意してください。これは、ある言語が他の言語よりも優れているという一般的なメリットについて議論する場所ではありません。私が本当に興味を持っているのは、明示的なベクトル化を使用してCの1つと同じくらい効率的なgfortranを生成するためのgfortranを同軸化する方法を見つけることができれば、SIMD最適化のみにコンパイラに依存しなければならない問題を例示するか、またはFortranコンパイラが対応するCコンパイラよりも優れている場合。


タイミングの問題の1つは、プロセッサが周波数ステップ/ターボモードを実行する場合、これらの結果がマップ全体に及ぶ可能性があることです。
ビル・バルト

1
あなたのdaxpy_c.cは現在、xの倍数でXを更新し、すべてでyを触れていません。あなたは...それは公平にするためにそれを修正することをお勧めします
ジャックPoulson

1
@JackPoulson:良いキャッチ、修正、結果の更新。
ペドロ

2
また、Fortranバージョンで手動で展開するとコンパイラが混乱するため、この違いは完全に原因であると確信しています。Cバージョンに入れたものと同じ単純なループに置き換えた場合、2つの間のパフォーマンスはほぼ同じです。変更がなければ、FortranバージョンはIntelコンパイラーで遅くなりました。
ジャックポールソン

1
@permeakra:実際、C99標準restrictは、コンパイラに次のことを正確に伝えるキーワードを指定しています。配列が他のデータ構造と重複しないと仮定するため。
ペドロ

回答:


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タイミングの違いは、ユニットストライドFortran daxpyを手動で展開したためと思われます。次のタイミングは、コマンドを使用した2.67 GHz Xeon X5650でのものです

./test 1000000 10000

Intel 11.1コンパイラー

手動で展開するFortran:8.7秒手動で展開する
Fortranなし:5.8秒手動で展開する
Cなし:5.8秒

GNU 4.1.2コンパイラ

手動展開を伴うFortran:8.3秒手動展開を伴わない
Fortran:13.5秒
手動展開を伴わない
C :13.6秒ベクター属性を伴うC:5.8秒

GNU 4.4.5コンパイラー

手動展開を伴うFortran:8.1秒
手動展開を 伴わないFortran:7.4秒
手動展開を
伴わないC :8.5秒ベクトル属性を伴うC:5.8秒

結論

  • 手動での展開は、このアーキテクチャのGNU 4.1.2 Fortranコンパイラーを支援しましたが、新しいバージョン(4.4.5)とインテルFortranコンパイラーを傷つけます。
  • GNU 4.4.5 Cコンパイラーは、バージョン4.2.1よりもFortranとはるかに競争力があります。
  • ベクトル組み込み関数を使用すると、GCCのパフォーマンスをIntelコンパイラーに一致させることができます。

dgemvやdgemmのようなより複雑なルーチンをテストする時間ですか?


結果をありがとう!どのバージョンのgccを使用していましたか?CPUについてもう少し詳しく教えていただけますか?
ペドロ

2
お使いのコンパイラはCPUよりも古いです... gcc-4.5で試していただけますか?
ペドロ

1
試したところです。GCC 4.4.5のベクトル化バージョンは、Intel 11.1の結果と完全に一致します。
ジャックポールソン

1
gcc / gfortranバージョン4.4.5をインストールしましたが、展開しないと違いを再現できません。実際、両方の場合に生成されたアセンブラーでは、使用されるレジスター名が交換可能であることを除いて、最も内側のループは同一です。念のためテストを再実行できますか?
ペドロ

4
この種のことで、「パフォーマンスが高いため、Fortranを使用し続けます」という古くからの議論を解決し、最終的にゴミ箱に捨てることができると言えるでしょうか。
ステファノボリーニ

16

私はこのパーティーに遅刻しているので、上記のすべてを行き来するのは難しいです。質問は大きく、もし興味があるなら、もっと小さな断片に分割できると思います。私が興味を持ったのは、単にdaxpyバリアントのパフォーマンスと、この非常に単純なコードでFortranがCより遅いかどうかです。

私のラップトップ(Macbook Pro、Intel Core i7、2.66 GHz)の両方で実行する場合、手動ベクトル化Cバージョンと非手動ベクトル化Fortranバージョンの相対的なパフォーマンスは、使用するコンパイラー(独自のオプションを使用)に依存します。

Compiler     Fortran time     C time
GCC 4.6.1    5408.5 ms        5424.0 ms
GCC 4.5.3    7889.2 ms        5532.3 ms
GCC 4.4.6    7735.2 ms        5468.7 ms

そのため、GCCは4.6ブランチのループのベクトル化が以前よりも改善されたようです。


全体的な議論では、アセンブリ言語とほとんど同じように、CとFortranの両方で高速で最適化されたコードを書くことができると思います。ただし、1つだけ指摘しておきます。アセンブラはCよりも書くのが面倒ですが、CPUによって実行される処理をより細かく制御できるように、CはFortranよりも低レベルです。したがって、Fortranの標準構文(またはベンダー拡張)に機能が欠けている可能性がある最適化に役立つ詳細をより詳細に制御できます。1つのケースは、ベクトル型の明示的な使用であり、もう1つは、Fortranでは不可能な、手動で変数のアライメントを指定する可能性です。


scicompへようこそ!この場合、コンパイラーのバージョンは言語と同じくらい重要であることに同意します。最後の文で「オフ」ではなく「of」を意味しましたか?
アロンアーマディア

9

FortranでAXPYを記述する方法は少し異なります。それは数学の正確な翻訳です。

m_blas.f90

 module blas

   interface axpy
     module procedure saxpy,daxpy
   end interface

 contains

   subroutine daxpy(x,y,a)
     implicit none
     real(8) :: x(:),y(:),a
     y=a*x+y
   end subroutine daxpy

   subroutine saxpy(x,y,a)
     implicit none
     real(4) :: x(:),y(:),a
     y=a*x+y
   end subroutine saxpy

 end module blas

それでは、プログラムで上記のルーチンを呼び出しましょう。

test.f90

 program main

   use blas
   implicit none

   real(4), allocatable :: x(:),y(:)
   real(4) :: a
   integer :: n

   n=1000000000
   allocate(x(n),y(n))
   x=1.0
   y=2.0
   a=5.0
   call axpy(x,y,a)
   deallocate(x,y)

 end program main

コンパイルして実行しましょう...

login1$ ifort -fast -parallel m_blas.f90 test.f90
ipo: remark #11000: performing multi-file optimizations
ipo: remark #11005: generating object file /tmp/ipo_iforttdqZSA.o

login1$ export OMP_NUM_THREADS=1
login1$ time ./a.out 
real    0 m 4.697 s
user    0 m 1.972 s
sys     0 m 2.548 s

login1$ export OMP_NUM_THREADS=2
login1$ time ./a.out 
real    0 m 2.657 s
user    0 m 2.060 s
sys     0 m 2.744 s

ループも明示的なOpenMPディレクティブも使用していないことに注意してください。これはCで可能でしょうか(つまり、ループと自動並列化を使用しません)?私はCを使用しないのでわかりません。


自動並列化はIntelコンパイラ(FortranとCの両方)の機能であり、言語の機能ではありません。したがって、Cの同等物も並列化されるはずです。好奇心から、より穏やかなn = 10000に対してどのように機能しますか?
ペドロ

3
それが全体のポイントでした。Fortranは(Cとは異なり)matmult、transposeなどの配列全体の操作をサポートしているため、FortranではAutoparが簡単です。したがって、Fortranコンパイラーではコードの最適化が容易です。現在使用しているGFortranには、Fortranコンパイラを最適化するための開発者リソースがありません。現在、最適化ではなくFortran 2003標準を実装することに重点が置かれています。
stali

うーん...インテルC / C ++コンパイラーiccも自動並列化を行います。icctest.c他のソースにファイルを追加しました。上記で使用したのと同じオプションでコンパイルして実行し、タイミングを報告できますか?gccがすべてを最適化するのを避けるために、printf-statementをコードに追加する必要がありました。これは簡単なハックであり、バグがないことを願っています!
ペドロ

最新のicc / ifortコンパイラをダウンロードし、テストを自分で行いました。質問は、これらの新しい結果を含むように更新されました。つまり、Intelの自動ベクトル化はFortranとCの両方で動作します。–
Pedro

1
ありがとう。はい、おそらくループは単純で、操作はレベル1 BLASであるため、ほとんど違いがないことに気付きました。しかし、配列操作全体を実行するFortranの能力と、PURE / ELEMENTALなどのキーワードの使用のために前に述べたように、コンパイラーの最適化の余地があります。コンパイラがこの情報をどのように使用し、実際に何をするかは、別のものです。bpaste.net/show/23035が必要な場合はmatmulを
stali

6

コンパイラが最新のハードウェア向けにコードを最適化する方法は興味深いだけではないと思います。特にGNU CとGNU Fortranでは、コード生成が大きく異なる場合があります。

そこで、それらの違いを示す別の例を考えてみましょう。

複素数を使用すると、GNU Cコンパイラーは、複素数での非常に基本的な算術演算に対して大きなオーバーヘッドを生成します。Fortranコンパイラは、はるかに優れたコードを提供します。Fortranの次の小さな例を見てみましょう。

COMPLEX*16 A,B,C
C=A*B

(gfortran -g -o complex.fo -c complex.f95; objdump -d -S complex.fo):

C=A*B
  52:   dd 45 e0                fldl   -0x20(%ebp)
  55:   dd 45 e8                fldl   -0x18(%ebp)
  58:   dd 45 d0                fldl   -0x30(%ebp)
  5b:   dd 45 d8                fldl   -0x28(%ebp)
  5e:   d9 c3                   fld    %st(3)
  60:   d8 ca                   fmul   %st(2),%st
  62:   d9 c3                   fld    %st(3)
  64:   d8 ca                   fmul   %st(2),%st
  66:   d9 ca                   fxch   %st(2)
  68:   de cd                   fmulp  %st,%st(5)
  6a:   d9 ca                   fxch   %st(2)
  6c:   de cb                   fmulp  %st,%st(3)
  6e:   de e9                   fsubrp %st,%st(1)
  70:   d9 c9                   fxch   %st(1)
  72:   de c2                   faddp  %st,%st(2)
  74:   dd 5d c0                fstpl  -0x40(%ebp)
  77:   dd 5d c8                fstpl  -0x38(%ebp)

これは39バイトのマシンコードです。Cで同じことを考えると

 double complex a,b,c; 
 c=a*b; 

そして、出力を見てみましょう(上記と同じ方法で行われます)。

  41:   8d 45 b8                lea    -0x48(%ebp),%eax
  44:   dd 5c 24 1c             fstpl  0x1c(%esp)
  48:   dd 5c 24 14             fstpl  0x14(%esp)
  4c:   dd 5c 24 0c             fstpl  0xc(%esp)
  50:   dd 5c 24 04             fstpl  0x4(%esp)
  54:   89 04 24                mov    %eax,(%esp)
  57:   e8 fc ff ff ff          call   58 <main+0x58>
  5c:   83 ec 04                sub    $0x4,%esp
  5f:   dd 45 b8                fldl   -0x48(%ebp)
  62:   dd 5d c8                fstpl  -0x38(%ebp)
  65:   dd 45 c0                fldl   -0x40(%ebp)
  68:   dd 5d d0                fstpl  -0x30(%ebp)

どちらも39バイトのマシンコードですが、機能ステップ57が参照するように、作業の適切な部分を実行し、目的の操作を実行します。したがって、マルチ操作を実行する27バイトのマシンコードがあります。背後の機能はmuldc3によって提供されlibgcc_s.so、マシンコードで1375バイトのフットプリントを持ちます。これにより、コードが大幅に遅くなり、プロファイラーを使用したときに興味深い出力が得られます。

上記のBLASの例を実装しzaxpyて同じテストを実行すると、FortranコンパイラーはCコンパイラーよりも良い結果を出すはずです。

(この実験ではGCC 4.4.3を使用しましたが、他のGCCがリリースするこの動作に気付きました。)

私の意見では、どちらがより良いコンパイラであるかを考えるとき、並列化とベクトル化について考えるだけでなく、基本的なものがアセンブラコードにどのように変換されるかを見なければなりません。この変換が不適切なコードを提供する場合、最適化はこれを入力としてのみ使用できます。


1
コードの行に沿って例を作成し、complex.cオンラインでコードに追加しました。何も最適化されていないことを確認するために、すべての入力/出力を追加する必要がありました。を__muldc3使用しない場合にのみ電話がかかります-ffast-math-O2 -ffast-math私は、インラインアセンブラの9行を取得します。これを確認できますか?
ペドロ

生成されたアセンブラの違いのより具体的な原因を発見し、上記の私の質問に追加しました。
ペドロ

-O2を使用すると、コンパイラーは実行時に可能なすべてのことを計算します。そのため、このような構成は失われることがあります。-ffast-mathオプションは、出力に依存する場合、科学計算で使用しないでください。
MK別名グリス

1
さて、その引数(no -ffast-math)により、複素数値の計算にFortranを使用すべきではありません。私の質問の更新で説明したように、-ffast-mathまたはより一般的には-fcx-limited-range、gcc はFortranの標準と同じIEEE以外の制限された範囲の計算を使用します。したがって、すべての範囲の複素数値と正しいInfsおよびNaNが必要な場合は、Fortranを使用しないでください。
Pedro

2
@Pedro:GCCをGFortran wrtのように動作させたい場合。複雑な乗算と除算では、-fcx-fortran-rulesを使用する必要があります。
ジャンネブ

4

皆さん、

この議論は非常に興味深いものでしたが、Matmulの例でループの順序を変更すると状況が変わったことに驚きました。現在のマシンではインテルコンパイラを使用できないため、gfortranを使用していますが、mm_test.f90のループを

call cpu_time(start)  
do r=1,runs  
  mat_c=0.0d0  
     do j=1,n  
        do k=1,n  
  do i=1,n  
           mat_c(i,j)=mat_c(i,j)+mat_a(i,k)*mat_b(k,j)  
        end do  
     end do  
  end do  
end do  
call cpu_time(finish)  

私のマシンの結果全体を変更しました。

以前のバージョンのタイミング結果は次のとおりです。

#time ./mm_test_f 10000 100
 matmul    time   6.3620000000000001     
 triple do time   21.420999999999999     

一方、上記のように再配置されたトリプルループでは、yeilded:

#time ./mm_test_f 10000 100
 matmul    time   6.3929999999999998     
 triple do time   3.9190000000000005    

これは、Intel(R)Core(TM)i7-2600K CPU @ 3.40GHz上のgcc / gfortran 4.7.2 20121109です。

使用されたコンパイラフラグは、ここで入手したMakefileからのものでした...


3
メモリ内のマトリックスストレージは1つの順序を優先するため、つまり、行が連続して格納されている場合は、繰り返しロードするよりも高速なローカルメモリに各行を一度にロードできるため、最も内側の行をループする方がよいため、これは驚くことではありません)単一の要素にアクセスします。stackoverflow.com/questions/7395556を参照してください。
クリスチャンクラソン

「内在的なmatmul」がこのように物事を行うためにコーディングされないことに驚いたと思います。2番目の方法でトリプルdoを使用すると、かなり高速になります。以前のバージョンのgfortranの方がタイミングが「フラット」だったため、このコンパイラセットにあるようです。どの方法でマルチを行ったとしても、ほぼ同じ時間でした。
シャッティ

-2

コードの実行を高速化する言語ではありませんが、助けにはなります。コードの実行を高速化するのは、コンパイラ、CPU、およびオペレーティングシステムです。言語を比較することは、誤った呼び名であり、役に立たず、無意味です。言語とコンパイラの2つの変数を比較しているため、まったく意味がありません。1つのコードがより高速に実行される場合、それが言語であるか、コンパイラーであるかはわかりません。コンピューターサイエンスコミュニティがなぜこれを理解していないのか、私にはわかりません:-(

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