特定のしきい値よりも低い要素を削除するには、配列をフィルタリングする必要があります。私の現在のコードは次のようなものです:
threshold = 5
a = numpy.array(range(10)) # testing data
b = numpy.array(filter(lambda x: x >= threshold, a))
問題は、ラムダ関数(遅い)を持つフィルターを使用して、一時リストを作成することです。
これは非常に単純な操作であるため、効率的な方法でそれを実行するnumpy関数があるかもしれませんが、私はそれを見つけることができませんでした。
これを実現する別の方法は、配列を並べ替え、しきい値のインデックスを見つけて、そのインデックスからスライスを返すことだと思いましたが、これが小さな入力の場合は高速であるとしても(とにかく目立たないでしょう) )、入力サイズが大きくなるにつれて、その効率は明らかに漸近的に低下します。
何か案は?ありがとう!
更新:私もいくつかの測定を行いましたが、入力が100.000.000エントリの場合、並べ替えとスライスは純粋なPythonフィルターの2倍の速さでした。
In [321]: r = numpy.random.uniform(0, 1, 100000000)
In [322]: %timeit test1(r) # filter
1 loops, best of 3: 21.3 s per loop
In [323]: %timeit test2(r) # sort and slice
1 loops, best of 3: 11.1 s per loop
In [324]: %timeit test3(r) # boolean indexing
1 loops, best of 3: 1.26 s per loop