4kを超える文字列から作成された述語でOracle clobを使用する

以下のOracle SELECT述語で使用するために、4000文字を超える文字列（file_dataバインド変数で提供）からCLOBを作成しようとしています。

myQuery=
select *
from dcr_mols
WHERE flexmatch(ctab,:file_data,'MATCH=ALL')=1;

TO_CLOB（）ラウンドfile_dataを追加すると、varcharの悪名高いOracle 4k制限に失敗します（<4k文字列の場合は問題ありません）。エラー（SQL Developerの場合）は次のとおりです。

ORA-01460: unimplemented or unreasonable conversion requested
01460. 00000 -  "unimplemented or unreasonable conversion requested"

FYI flexmatch関数は分子の検索に使用され、ここで説明されています：http ://help.accelrysonline.com/ulm/onelab/1.0/content/ulm_pdfs/direct/developers/direct_2016_developersguide.pdf

関数自体は少し複雑ですが、本質は2番目のパラメーターがCLOBでなければなりません。したがって、私の質問は、4000文字を超えるJava文字列bind_variableをSQL（またはJava）のCLOBに変換する方法です。

私は以下を使用してJava（Spring boot 2）で以下の方法（CLOBを挿入するときに機能します）を試しました：

MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
parameters.addValue("file_data", fileDataStr,Types.CLOB);
jdbcNamedParameterTemplate.query(myQuery,parameters,…

この方法は機能するはずですが、FYIである収束したflexmatchエラーで失敗します。

SQL state [99999]; error code [29902]; ORA-29902: error in executing ODCIIndexStart() routine\nORA-20100: 
MDL-0203: Unable to read from CLOB (csfrm=1, csid=873): 
ORA-22922: nonexistent LOB value\nMDL-0021: Unable to copy LOB to string\nMDL-1051: Molstructure search query is not a valid molecule\nMDL-0976: 
Molecule index search initialization failed\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 329\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 309\n; nested exception is java.sql.SQLException: 
ORA-29902: error in executing ODCIIndexStart() routine\nORA-20100: MDL-0203: Unable to read from CLOB (csfrm=1, csid=873): 
ORA-22922: nonexistent LOB value\nMDL-0021: Unable to copy LOB to string\nMDL-1051: Molstructure search query is not a valid molecule\nMDL-0976: 
Molecule index search initialization failed\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 329\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 309\n"

SpringBoot 2を使用していますが、Oracle Connection（Spring NamedParametersJdbcTemplateオブジェクトから取得）を使用して（clobs <4kでも）機能するメソッドを取得できないため、私は何か愚かなことをしたのではないかと思います。私はもう試した：

 @Autowired
 NamedParameterJdbcTemplate  jdbcNamedParameterTemplate;
OracleConnection conn =  this.jdbcNamedParameterTemplate.getJdbcTemplate().getDataSource().getConnection().unwrap(OracleConnection.class);
Clob myClob =  conn.createClob();
myClob.setString( 1, fileDataStr);
MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
parameters.addValue("file_data", myClob,Types.CLOB);

application.properties：

spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@//${ORA_HOST}:${ORA_PORT}/${ORA_SID}
spring.datasource.username=${ORA_USER}
spring.datasource.password=${ORA_PASS}

私が古い学校に行って、スプリング以外の接続に加えて、setClob（）メソッドを持つPreparedStatementを使用すると、問題なく機能することに注意してください。

OracleDataSource ods = new OracleDataSource();
String url ="jdbc:oracle:thin:@//" + ORA_HOST +":"+ORA_PORT +"/"+ORA_SID;
ods.setURL(url);
ods.setUser(user);
ods.setPassword(passwd);
Connection conn = ods.getConnection();
Clob myClob=conn.createClob();
PreparedStatement ps = conn.prepareStatement("select dcr_number from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1");
myClob.setString(1,myMol);
ps.setClob(1,myClob);
ResultSet rs =ps.executeQuery();

しかし、私はJavaまたはSqlのSpring 2ソリューションを好みます。どんな助け、提案も歓迎します。

それをストリーミングします。SQLステートメントに巨大な値を貼り付けることはできません。

次のことを行う必要があります。

• INSERTステートメントに空のBLOBを挿入します（EMPTY_BLOB（）を使用しますか？...よく覚えていません）。
• 空のblobの出力ストリームを取得します。
• 次に、ファイルから入力ストリームを取得します。ファイル全体をメモリにロードしないでください。
• 次に、バッファリングを使用して、ブロックを入力ストリームから出力ストリームに転送します。16 KBのバッファで十分です。
• 両方のストリームを閉じます。

これは、Oracleで大量のデータを処理する標準的な方法です。そこにはたくさんの例があります。

大量のデータ（BLOBおよびCLOBタイプ）の取得も同じように機能します。その場合は、InputStreamsを使用してください。

「BIOVIA Direct」APIのドキュメントを読むと、27ページに興味深い例があり、以下に抜粋します。

select ...
from ...
where flexmatch(
ctab,
(select ctab from nostruct_table),
'all'
)=1

すでにロードされている CLOBを使用します。したがって、適切な解決策は、CLOBを自分のテーブルにロードして（または事前にすべて事前にロードして）、そのまま使用することです。

ステップ＃1-CLOBをテーブルにロードします。

create table mol_file (
  id number(12) primary key not null,
  content clob
);

insert into mol_file (id, content) values (:id, :content);

そして、Javaコードを使用して、（おそらくストリームを使用して）CLOB挿入を実行します。これは、別の回答（インターネットにある多くの例）に示されています。たとえば、molデータコンテンツをID =で挿入します123。

ステップ＃2-既にロードされたmolファイルを使用してクエリを実行します。

select *
from dcr_mols
WHERE flexmatch(
        ctab,
        (select content from mol_file where id = :id),
        'MATCH=ALL'
      ) = 1;

以前にロードしたファイル（またはその他のファイル）を使用するように:idパラメーターを設定でき123ます。

このようにして、古いファッション関数を呼び出すことができます。ResultSetを処理するクラスを作成する

 class MyPreparedStatementCallback implements PreparedStatementCallback {
    public Object doInPreparedStatement(PreparedStatement preparedStatement)
            throws SQLException, DataAccessException {
        ResultSet rs = preparedStatement.executeQuery();
        List result = new LinkedList();
        rs.close();
        return result;
    }
}

メソッドでJdbcTemplateを使用してクエリを呼び出します

 jdbcTemplate.execute(new PreparedStatementCreator() {
        @Override
        public PreparedStatement createPreparedStatement(Connection connection)

                throws SQLException, DataAccessException {

            PreparedStatement ps = connection.prepareStatement("select dcr_number from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1");
            Clob myClob =  connection.createClob();
            myClob.setString( 1, fileDataStr);
            MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
            parameters.addValue("file_data", myClob, Types.CLOB);
            ps.setClob(1,myClob);
            return ps;

        };
    }, new MyPreparedStatementCallback());

PreparedStatementの使用に戻す必要がありましたが、Springから接続を取得し、Apache Commons BeanListHandlerを使用してResultSetをオブジェクトリストにマップすることにより、通常の実装を少し改善しました

import org.apache.commons.dbutils.ResultSetHandler;
import org.apache.commons.dbutils.handlers.BeanListHandler;

@Autowired
NamedParameterJdbcTemplate  jdbcTemplate;

List<MyDao> myMethod(String fileData){
    String myQuery="select * from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1";

try {
    Connection conn =  this.jdbcTemplate.getJdbcTemplate().getDataSource().getConnection().unwrap(OracleConnection.class);   // Get connection from spring

    Clob myClob =  conn.createClob();   // Open a dB clob 
    myClob.setString( 1, fileData);     // add data to clob
    PreparedStatement ps = conn.prepareStatement(myQuery);
    ps.setClob(1,myClob);              // Add a clob into the PreparedStatement
    ResultSet rs =ps.executeQuery();   // Execute the prepared statement

    //ResultSetHandler<List<MyDao>> handler = new BeanListHandler<MyDao>(MyDao.class);   // Define the ResultSet handler
    ResultSetHandler<List<MyDao>> handler = new BeanListHandler<MyDao>(MyDao.class, new BasicRowProcessor(new GenerousBeanProcessor()));  // This is better than the above handler , because GenerousBeanProcessor removes the requirement for the column names to exactly match the java variables

    List<MyDao> myDaoList = handler.handle(rs);   // Map ResultSet to List of MyDao objects
    }catch (Exception e) {
        e.printStackTrace();
    }

return myDaoList;
}

接続であるconを使用して、fileDataStrをCLOBとして宣言できます。

java.sql.Clob fileDataStr = oracle.sql.CLOB.createTemporary
(con, false, oracle.sql.CLOB.DURATION_SESSION);

以下のように使用します

 parameters.addValue("file_data", fileDataStr,Types.CLOB);

また、接続文字列でサービス名の代わりにSIDを使用している場合は、以下のようにプロパティファイルを変更してみてください

spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@//${ORA_HOST}:${ORA_PORT}:${ORA_SID}