2つの列に基づいて重複行を識別してマークを付けたいのですが。行が重複していることだけでなく、どの行と重複しているかがわかるように、重複ごとに一意の識別子を作成したいと思います。以下のようなデータフレームがあり、重複したアイテムのペア（フィットとシット）と、重複していない他のペアがあります。アイテムのペアは複製されますが、それらに含まれる情報は一意です（たとえば、1つの行のValue1には1つの行の値がありますが、Value2とValue 3ではありません。 Value1ではありません）

現在のデータフレーム

     value1 value2 value3 fit   sit  
[1,] "1"    NA     NA     "it1" "it2"
[2,] NA     "3"    "2"    "it2" "it1"
[3,] "2"    "3"    "4"    "it3" "it4"
[4,] NA     NA     NA     "it4" "it3"
[5,] "5"    NA     NA     "it5" "it6"
[6,] NA     NA     "2"    "it6" "it5"
[7,] NA     "4"    NA     "it7" "it9"

サンプルデータフレームを生成するコード

value1<-c(1,NA,2,NA,5,NA,NA)
value2<-c(NA,3,3,NA,NA,NA, 4)
value3<-c(NA,2,4,NA,NA,2, NA)
fit<-c("it1","it2","it3","it4", "it5", "it6","it7")
sit<-c("it2","it1","it4","it3", "it6", "it5", "it9")
df.now<-cbind(value1,value2,value3, fit, sit)

私が欲しいのは、それを次のようなデータフレームに変換することです：

必要なデータフレーム

     val1 val2 val3 it1   it2  
[1,] "1"  "3"  "2"  "it1" "it2"
[2,] "2"  "3"  "4"  "it3" "it4"
[3,] "5"  NA   "2"  "it5" "it6"
[4,] NA   "4"  NA   "it7" "it9"

私は次の手順を実行することを考えていました：1. fitを使用して新しい変数を作成し、最低のアイテムと最高のアイテムで座って重複ペアを識別します2.重複アイテムのペアを識別します3. ifelseを使用して一意の情報を選択して入力します。

手順1と3の実行方法は知っていますが、手順2で行き詰まっています。必要なのは、TRUE / FALSEの重複を識別するだけではなく、このような各アイテムのペアに一意の識別子を持つ列があることです（ある私のステップ1）のために2つの余分な行があります：

     value1 value2 value3 fit   sit   lit   hit    dup
[1,] "1"    NA     NA     "it1" "it2" "it1" "it2"   1
[2,] NA     "3"    "2"    "it2" "it1" "it1" "it2"   1
[3,] "2"    "3"    "4"    "it3" "it4" "it3" "it4"   2
[4,] NA     NA     NA     "it4" "it3" "it3" "it4"   2
[5,] "5"    NA     NA     "it5" "it6" "it5" "it6"   3
[6,] NA     NA     "2"    "it6" "it5" "it5" "it6"   3
[7,] NA     "4"    NA     "it7" "it9" "it7" "it9"   NA

これを行う方法がわかりません。

私が求めているのは、ステップ2の助けになるか、おそらく私が概説したステップよりもそれを解決するより良い方法があるでしょう。

1つのdplyrオプションは次のとおりです。

df.now %>%
 group_by(pair = paste(pmax(fit, sit), pmin(fit, sit), sep = "_")) %>%
 summarise_at(vars(starts_with("value")), ~ ifelse(all(is.na(.)), 
                                                   NA,
                                                   first(na.omit(.))))

  pair    value1 value2 value3
  <chr>    <dbl>  <dbl>  <dbl>
1 it2_it1      1      3      2
2 it4_it3      2      3      4
3 it6_it5      5     NA      2
4 it9_it7     NA      4     NA

また、個々の列のペアも必要な場合は、追加するとtidyr次のようになります。

df.now %>%
 group_by(pair = paste(pmax(fit, sit), pmin(fit, sit), sep = "_")) %>%
 summarise_at(vars(starts_with("value")), ~ ifelse(all(is.na(.)), 
                                                   NA,
                                                   first(na.omit(.)))) %>%
 separate(pair, into = c("fit", "hit"), sep = "_", remove = FALSE)

  pair    fit   hit   value1 value2 value3
  <chr>   <chr> <chr>  <dbl>  <dbl>  <dbl>
1 it2_it1 it2   it1        1      3      2
2 it4_it3 it4   it3        2      3      4
3 it6_it5 it6   it5        5     NA      2
4 it9_it7 it9   it7       NA      4     NA

ING !duplicated()後に使用してくださいsort。

df.now[!duplicated(t(apply(df.now[, c("fit", "sit")], 1, sort))), ]
#       value1 value2 value3 fit   sit  
# [1,] "1"    NA     NA     "it1" "it2"
# [2,] "2"    "3"    "4"    "it3" "it4"
# [3,] "5"    NA     NA     "it5" "it6"
# [4,] NA     "4"    NA     "it7" "it9"

melt/dcastからの使用data.table

library(data.table)
dcast(melt(setDT(df.now)[, c('fit1', 'sit1') := .(pmin(fit, sit), 
    pmax(fit, sit))], measure = patterns("^value"), na.rm = TRUE),
     fit1 + sit1 ~ variable, value.var = 'value')
#   fit1 sit1 value1 value2 value3
#1:  it1  it2      1      3      2
#2:  it3  it4      2      3      4
#3:  it5  it6      5     NA      2
#4:  it7  it9     NA      4     NA

データ

df.now <- data.frame(value1,value2,value3, fit, sit, stringsAsFactors = FALSE)

別のdata.tableオプション：

library(data.table)
as.data.table(df.now)[, lapply(.SD, function(x) first(x[!is.na(x)])), 
    .(it1=pmin(fit, sit), it2=pmax(fit, sit)), 
    .SDcols=value1:value3]

出力：

   it1 it2 value1 value2 value3
1: it1 it2      1      3      2
2: it3 it4      2      3      4
3: it5 it6      5   <NA>      2
4: it7 it9   <NA>      4   <NA>

これがdata.tableを使用した私の試みです。データはと呼ばれmydfます。まず、私はソートfitとsit、各行に対して、新たな変数を作成しましたgroup。次に、各グループについて、3つの値列（つまり、value1、value2、およびvalue3）の値を並べ替えました。最後に、各グループの最初の行を抽出しました。

library(data.table)

mydt <- setDT(mydf)[, group := paste(sort(.SD), collapse = "_"),
                    .SD = c("fit", "sit"), by = 1:nrow(mydf)][,
                        c("value1", "value2", "value3") := lapply(.SD, sort),
                        .SDcols = value1:value3, by = group][, .SD[1], by = group]

mydt[]

#     group value1 value2 value3 fit sit
#1: it1_it2      1      3      2 it1 it2
#2: it3_it4      2      3      4 it3 it4
#3: it5_it6      5     NA      2 it5 it6
#4: it7_it9     NA      4     NA it7 it9

データ

mydf <- structure(list(value1 = c(1L, NA, 2L, NA, 5L, NA, NA), value2 = c(NA, 
3L, 3L, NA, NA, NA, 4L), value3 = c(NA, 2L, 4L, NA, NA, 2L, NA
), fit = c("it1", "it2", "it3", "it4", "it5", "it6", "it7"), 
sit = c("it2", "it1", "it4", "it3", "it6", "it5", "it9")), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-7L))

また、これは使用して行うことができるtidyrのpivot_longerとvalues_drop_na = TRUEと組み合わせますpivot_wider：

library(tidyverse)

mydf %>%
   mutate(it1 = pmin(fit, sit), it2 = pmax(fit, sit)) %>%
   pivot_longer(cols = starts_with("value"), values_drop_na = TRUE) %>%
   pivot_wider(id_cols = c("it1", "it2"))

#> # A tibble: 4 x 5
#>   it1   it2   value1 value2 value3
#>   <chr> <chr>  <int>  <int>  <int>
#> 1 it1   it2        1      3      2
#> 2 it3   it4        2      3      4
#> 3 it5   it6        5     NA      2
#> 4 it7   it9       NA      4     NA

データ

mydf <- structure(list(value1 = c(1L, NA, 2L, NA, 5L, NA, NA), value2 = c(NA, 
3L, 3L, NA, NA, NA, 4L), value3 = c(NA, 2L, 4L, NA, NA, 2L, NA
), fit = c("it1", "it2", "it3", "it4", "it5", "it6", "it7"), 
sit = c("it2", "it1", "it4", "it3", "it6", "it5", "it9")), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-7L))