conda環境を作成する：「競合が見つかりました！」環境を解決し、「最短の競合パスを見つける」が永久に実行されている場合

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environment.ubuntu.ymlconda環境を作成するためのファイルが提供されました。ただし、実行するconda create env --file environment.ubuntu.ymlと次の出力が表示されます。

conda env create --file environment.ubuntu.yml
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: - 
Found conflicts! Looking for incompatible packages.
This can take several minutes.  Press CTRL-C to abort.
Examining fontconfig:   5%|▉                 | 10/202 [00:00<00:00, 5393.91it/ ]
Comparing specs that have this dependency:   0%|         | 0/12 [00:00<?, ?it/s]
Finding shortest confli|  path for fontconfig==2.13.1=he4413a7_1000:  12%|▏| 1/8
Finding shortest conflict path for fontconfig==2.13.1=he4413a7_1000:  25%|▎| 2/8
Finding shortest conflict pa/  for fontconfig[version='>=2.13.0,<3.0a0']:  25%|
Finding shortest conflict path for fontconfig[version='>=2.13.0,<3.0a0']:  38%|
Finding shortest conf- ct path for fontconfig[version='>=2.11.1']:  38%|▍| 3/8 [
Finding shortest conflict path for fontconfig[version='>=2.11.1']:  50%|▌| 4/8 [
Finding shortest conflict pa|  for fontconfig[version='>=2.12.4,<3.0a0']:  50%|
...

Finding shortest conflict pathどうやら、いくつかの依存関係の問題を解決することを試みている-長い時間のために行きます。2時間実行しても、停止するかどうかは不明です。

私の質問は、ここで何が起こっているのか、そして不要な依存関係を削除するなどして、手動でこのプロセスをスピードアップできますか？私は環境を作成しなかったので、どちらが実際に必要かわかりません。

私が好奇心をそそる理由は、それがのパスと同じようfontconfig[version='>=2.12.6,<3.0a0']に競合パスをチェックしdependenciesていて2.13.1、それをインストールしたからです2.13.1

以下の.ymlファイルを参照してください。

name: cea
channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - dlr-sc
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - conda-forge
  - conda-forge/label/gcc7
  - defaults
dependencies:
  - attrs=19.1.0=py_0
  - backports=1.0=py_2
  - backports.functools_lru_cache=1.5=py_1
  - backports_abc=0.5=py_1
  - boost-cpp=1.68.0=h11c811c_1000
  - bzip2=1.0.6=h14c3975_1002
  - ca-certificates=2019.3.9=hecc5488_0
  - cairo=1.14.12=h80bd089_1005
  - certifi=2019.3.9=py27_0
  - click=7.0=py_0
  - click-plugins=1.0.4=py_0
  - cligj=0.5.0=py_0
  - curl=7.64.1=hf8cf82a_0
  - cycler=0.10.0=py_1
  - descartes=1.1.0=py_2
  - enum34=1.1.6=py27_1001
  - expat=2.2.5=hf484d3e_1002
  - fiona=1.8.6=py27hf242f0b_2
  - fontconfig=2.13.1=he4413a7_1000
  - freetype=2.10.0=he983fc9_0
  - freexl=1.0.5=h14c3975_1002
  - functools32=3.2.3.2=py_3
  - futures=3.2.0=py27_1000
  - gdal=2.4.1=py27h5f563d9_8
  - geopandas=0.4.1=py_1
  - geos=3.7.1=hf484d3e_1000
  - geotiff=1.4.3=h1105359_1000
  - gettext=0.19.8.1=hc5be6a0_1002
  - giflib=5.1.7=h516909a_1
  - glib=2.56.2=had28632_1001
  - hdf4=4.2.13=h9a582f1_1002
  - hdf5=1.10.4=nompi_h3c11f04_1106
  - icu=58.2=hf484d3e_1000
  - jpeg=9c=h14c3975_1001
  - json-c=0.13.1=h14c3975_1001
  - kealib=1.4.10=h1978553_1003
  - kiwisolver=1.0.1=py27h6bb024c_1002
  - krb5=1.16.3=h05b26f9_1001
  - libblas=3.8.0=4_openblas
  - libcblas=3.8.0=4_openblas
  - libcurl=7.64.1=hda55be3_0
  - libdap4=3.19.1=hd48c02d_1000
  - libedit=3.1.20170329=hf8c457e_1001
  - libffi=3.2.1=he1b5a44_1006
  - libgdal=2.4.1=heae24aa_8
  - libiconv=1.15=h516909a_1005
  - libkml=1.3.0=h328b03d_1009
  - liblapack=3.8.0=4_openblas
  - libnetcdf=4.6.2=hbdf4f91_1001
  - libpng=1.6.36=h84994c4_1000
  - libpq=11.2=h4770945_0
  - libspatialindex=1.9.0=he1b5a44_0
  - libspatialite=4.3.0a=hb5ec416_1026
  - libssh2=1.8.2=h22169c7_2
  - libtiff=4.0.10=h648cc4a_1001
  - libuuid=2.32.1=h14c3975_1000
  - libxcb=1.13=h14c3975_1002
  - libxml2=2.9.8=h143f9aa_1005
  - mapclassify=1.0.1=py27_1
  - matplotlib=2.2.3=py27h8a2030e_1
  - matplotlib-base=2.2.3=py27h60b886d_1
  - munch=2.3.2=py_0
  - ncurses=6.1=hf484d3e_1002
  - numpy=1.16.2=py27h8b7e671_1
  - openblas=0.3.5=h9ac9557_1001
  - openjpeg=2.3.0=hf38bd82_1003
  - openssl=1.1.1b=h14c3975_1
  - pandas=0.24.2=py27hf484d3e_0
  - pip=19.0.3=py27_0
  - pixman=0.34.0=h14c3975_1003
  - poppler=0.67.0=h2fc8fa2_1002
  - poppler-data=0.4.9=1
  - postgresql=11.2=h61314c7_0
  - proj4=5.2.0=h14c3975_1001
  - pthread-stubs=0.4=h14c3975_1001
  - pyparsing=2.3.1=py_0
  - pyproj=1.9.6=py27hc0953d3_1000
  - pyqt=5.6.0=py27h13b7fb3_1008
  - python=2.7.15=h721da81_1008
  - python-dateutil=2.8.0=py_0
  - pytz=2018.9=py_0
  - readline=7.0=hf8c457e_1001
  - rtree=0.8.3=py27h666c49c_1002
  - scipy=1.2.1=py27h09a28d5_1
  - setuptools=40.8.0=py27_0
  - shapely=1.6.4=py27h2afed24_1003
  - singledispatch=3.4.0.3=py27_1000
  - sip=4.18.1=py27hf484d3e_1000
  - six=1.12.0=py27_1000
  - sqlite=3.26.0=h67949de_1001
  - subprocess32=3.5.3=py27h14c3975_0
  - tbb=2019.5=hc9558a2_0
  - tk=8.6.9=h84994c4_1001
  - tornado=5.1.1=py27h14c3975_1000
  - tzcode=2018g=h14c3975_1001
  - wheel=0.33.1=py27_0
  - xerces-c=3.2.2=hac72e42_1001
  - xorg-kbproto=1.0.7=h14c3975_1002
  - xorg-libice=1.0.9=h516909a_1004
  - xorg-libsm=1.2.3=h84519dc_1000
  - xorg-libx11=1.6.7=h14c3975_1000
  - xorg-libxau=1.0.9=h14c3975_0
  - xorg-libxdmcp=1.1.3=h516909a_0
  - xorg-libxext=1.3.4=h516909a_0
  - xorg-libxrender=0.9.10=h516909a_1002
  - xorg-renderproto=0.11.1=h14c3975_1002
  - xorg-xextproto=7.3.0=h14c3975_1002
  - xorg-xproto=7.0.31=h14c3975_1007
  - xz=5.2.4=h14c3975_1001
  - zlib=1.2.11=h14c3975_1004
  - freeimageplus=3.18.0=hf484d3e_2
  - gl2ps=1.3.8=h14c3975_4
  - oce=0.17.2=h6bb024c_10
  - pythonocc-core=0.17=py27_1
  - mkl=2017.0.3=0
  - mkl-service=1.1.2=py27_3
  - dbus=1.13.2=h714fa37_1
  - gst-plugins-base=1.14.0=hbbd80ab_1
  - gstreamer=1.14.0=hb453b48_1
  - libgcc-ng=8.2.0=hdf63c60_1
  - libgfortran-ng=7.3.0=hdf63c60_0
  - libstdcxx-ng=8.2.0=hdf63c60_1
  - pcre=8.43=he6710b0_0
  - qt=5.6.3=h8bf5577_3
  - pip:
    - alabaster==0.7.12
    - babel==2.6.0
    - backports.shutil-get-terminal-size==1.0.0
    - bleach==3.1.0
    - chardet==3.0.4
    - cloudpickle==0.8.1
    - configparser==3.7.4
    - cvxopt==1.2.3
    - decorator==4.4.0
    - defusedxml==0.5.0
    - docutils==0.14
    - doit==0.29.0
    - entrypoints==0.3
    - ephem==3.7.6.0
    - funcsigs==1.0.2
    - h5py==2.9.0
    - idna==2.8
    - imagesize==1.1.0
    - importlib-resources==1.0.2
    - ipaddress==1.0.22
    - ipykernel==4.10.0
    - ipython==5.8.0
    - ipython-genutils==0.2.0
    - ipywidgets==7.4.2
    - jinja2==2.10
    - joblib==0.12.5
    - jsonschema==3.0.1
    - jupyter==1.0.0
    - jupyter-client==5.2.4
    - jupyter-console==5.2.0
    - jupyter-core==4.4.0
    - llvmlite==0.28.0
    - lxml==4.3.3
    - markupsafe==1.1.1
    - mistune==0.8.4
    - mock==2.0.0
    - nbconvert==5.4.1
    - nbformat==4.4.0
    - networkx==2.2
    - notebook==5.7.8
    - numba==0.43.1
    - packaging==19.0
    - pandocfilters==1.4.2
    - pathlib2==2.3.3
    - patsy==0.5.1
    - pbr==5.1.3
    - pexpect==4.6.0
    - pickleshare==0.7.5
    - pkginfo==1.5.0.1
    - plotly==3.7.1
    - prometheus-client==0.6.0
    - prompt-toolkit==1.0.15
    - ptyprocess==0.6.0
    - py4design==0.27
    - pycollada==0.6
    - pygments==2.3.1
    - pyinotify==0.9.6
    - pymc3==3.6
    - pymf==0.1.9
    - pyrsistent==0.14.11
    - pysal==1.14.4.post2
    - pyshp==2.1.0
    - pyyaml==5.1
    - pyzmq==18.0.1
    - qtconsole==4.4.3
    - readme-renderer==24.0
    - requests==2.21.0
    - requests-toolbelt==0.9.1
    - retrying==1.3.3
    - salib==1.2
    - scandir==1.10.0
    - scikit-learn==0.20.3
    - seaborn==0.9.0
    - send2trash==1.5.0
    - simplegeneric==0.8.1
    - snowballstemmer==1.2.1
    - sphinx==1.8.5
    - sphinxcontrib-websupport==1.1.0
    - terminado==0.8.2
    - testpath==0.4.2
    - theano==1.0.4
    - timezonefinder==4.0.1
    - tqdm==4.31.1
    - traitlets==4.3.2
    - twine==1.13.0
    - typing==3.6.6
    - urllib3==1.24.1
    - utm==0.4.2
    - wcwidth==0.1.7
    - webencodings==0.5.1
    - widgetsnbextension==3.4.2
    - xlrd==1.2.0
    - xlwt==1.3.0
    - deap==1.3.0

— トイヴォ・サウェン
ソース

2

ええ、それは混乱です。どこから始めるか...これの多くは不要である可能性が高いです（中国にいない場合は、これらの中国のミラーチャネルは絶対に必要ありません）。私があなたがこれを直接整理するのを助ける私たちの絶望。あなたが実行しようとしているコードベースが実際にある場合は、あなたの最善のチャンスです。インポートステートメント用のGREP。インポートされたものだけを保持します。そして、何かがコンダで同等のパッケージを持っている場合、それは実際にpipセクションから移動されるべきですが、それは単に良い習慣であり、envを作成するというあなたの目標に向けてあまり移動しません。

— merv

@merv私はこれが答えだと心配していました。なぜそれがのようversion='>=2.12.6,<3.0a0'に競合パスをチェックしているのか、そしてそれをでインストールした理由に興味dependenciesが2.13.1ありconda install fontconfig=2.13.1ます。

— ToivoSäwén19年

よくわかりません。私が推測する必要がある場合、Condaが競合解決モードに入ると、明示的な仕様fontconfig=2.13.1を、依存関係（たとえばfontconfig[version='>=2.12.6,<3.0a0']）を持つすべてのパッケージからの制約とともに、別の制約として扱い、検索しようとするようです交差点。おそらく、すべての仕様がビルドまで明示的であるため、実際には小刻みの余地がないということに気づかないだけかもしれません。

— merv

7

このエラーとその後の動作は、ローカル環境で時々不整合を引き起こすアナコンダのバグが原因である可能性が非常に高いです。2020年1月26日の時点で、バグはまだ解決されていません。

私にとっては、同じ問題がMacでも深刻に現れています。

— ソフロス
ソース

3

一般に、この質問に対する答えは、必要なチャネルと制約のみを使用して、.ymlを手動でゼロから作成する必要があることです。バージョンの制約を緩和して、1.19.10ではなく1.19のように見えるようにする必要があります。

しかし、このアドバイスに従ったにも関わらず、私は今まさにあなたの問題を抱えています。fontconfigに何時間も費やしたので、あきらめる前に一晩放置しました。私のスペックはかなりシンプルです：

channels:
  - conda-forge
  - usgs-astrogeology
  - defaults
dependencies:
  - python=3.6
  - isis3
  - gdal=2.3

理解できたら編集します。

編集：この問題はここで議論中です（私がセットアップしようとしていたソフトウェアに固有で、おそらく他の人には役に立たないでしょう）https://github.com/USGS-Astrogeology/ISIS3/issues/3570

— フーバーバーベキュー
ソース

1

私の場合、...=he4413a7_1000元のファイルのバージョンがのように再ラベル付けさbrokenれていたため、一部のビルドバージョン（パーツ）を置き換えましたconda-forge。ただし、これらの依存関係のバージョン番号は変更されていませんが、それらのサブ依存関係が変更されているため、これらすべての競合が発生しています。つまり、依存関係を手動で変更しないでください。

元のビルドバージョンの仕様を維持し、ファイルの一部に追加conda-forge/labels/brokenすることで問題を解決しました。channels.yml

— トイヴォ・サウェン
ソース

0

2020年2月17日の時点で最新のビルドであるanaconda（python 3.7）でpycharmを使用すると、Windows 10でも同じ問題に直面しました。奇妙なことに、pycharmの設定でプロジェクトインタープリターページの「use condaパッケージマネージャー」を切り替えると、numpyを更新してパッケージを正常にインストールできました。condaパッケージマネージャーを使わずに、condaパッケージマネージャーを使ってパッケージをインストールしてみてください。幸運を！

— 冷凍レンジャー
ソース

-1

私はこの問題に会って解決しました。まず、anacondaのバージョンを、yamlファイルのエクスポート元と一致するようにしました。これは役に立たないかもしれませんが、一貫したcondaバージョンが一貫した基本環境を約束できると私は考えています。次に、すべての依存関係を削除しましたが、yamlファイルで実際に使用したい「メイン」パッケージの一部を削除しました。つまり、これらの「メイン」パッケージに依存関係の問題を処理させます。

— バラックス
ソース

-1

私にとっては、以下をyamlファイルに追加するとうまくいきました：

channels:
  - conda-forge
  - defaults
  - conda-forge/label/broken

— フランクタップ
ソース

これは別の回答ですでに書いていますか？

— ToivoSäwén

申し訳ありませんが、あなたは正しいです

— フランクタップ

-2

私にとっては最善を尽くしました：

which python （anaconda3ビンにあったことを確認します）

python --version
conda search "^python$"

Anacondaで使用しているバージョン（ここでは3.7.3）と一致するバージョンに注意してください（新しい環境を作成しているため、Anaconda自体が使用しているのと同じバージョンのPythonを使用できるのは当然です）。コンダチャネル（上記のコンダ検索）からの私のリストには、1つの3.7.3行しか表示されなかったことに注意してください。

次にこれを行います：

conda create -n myenv python=3.7.3 anaconda

最後のコマンドを実行するのに約1分かかりました:)

— キャメロンタリースミス
ソース