Python MD5ハッシュは、シェルでmd5sumコマンドによって作成されたものとは異なります。どうして?
>>> import hashlib
>>> h = hashlib.md5()
>>> h.update("mystringforhash")
>>> print h.hexdigest()
86b6423cb6d211734fc7d81bbc5e11d3 # Result from Python
$ echo mystringforhash | md5sum
686687dd68c5de717b34569dbfb8d3c3 - # Result on the shell