私は最近Xcode 4にアップグレードしました(これは素晴らしいアップグレードです)が、今は以前には得られなかったいくつかの警告が出ます。私はフォーラムや他のSOの投稿を調べましたが、これを修正する方法に遭遇していません。
表示される警告は、不足しているファイルに対するプロジェクトレベルの警告です。表示されているファイルは、プロジェクトナビゲータービューから削除されました(ファイルシステムからの削除も選択しています)。ただし、ファイルがプロジェクトナビゲーターに表示されなくなっても、プロジェクトにリンクされているように見えます。
私は周りを見回しましたが、これらのファイルがなくなったことをXcodeに伝える方法を見つけられませんでした。警告を表示しないでください。Xcode4で取得したスクリーンショットですが、Xcode 3では取得できません。