科学的表記なしで、与えられた精度でnumpy.arrayをきれいに出力する方法は?


332

numpy.arraysたとえば、次のような方法でフォーマットされたを印刷する方法があるかどうか知りたいです。

x = 1.23456
print '%.3f' % x

numpy.array浮動小数点数を出力したい場合は、小数配列が出力されます。多くの場合、「科学的」形式で出力されます。これは、低次元配列であっても読みにくいです。ただし、numpy.array明らかに、文字列として、つまりで印刷する必要があります%s。これに対する解決策はありますか?


この議論は、グーグル検索を介してここに到達する人たちにも興味があるかもしれません。
Foad 2018年

回答:


558

を使用set_printoptionsして、出力の精度を設定できます。

import numpy as np
x=np.random.random(10)
print(x)
# [ 0.07837821  0.48002108  0.41274116  0.82993414  0.77610352  0.1023732
#   0.51303098  0.4617183   0.33487207  0.71162095]

np.set_printoptions(precision=3)
print(x)
# [ 0.078  0.48   0.413  0.83   0.776  0.102  0.513  0.462  0.335  0.712]

またsuppress、小さい数の科学表記法の使用を抑制します。

y=np.array([1.5e-10,1.5,1500])
print(y)
# [  1.500e-10   1.500e+00   1.500e+03]
np.set_printoptions(suppress=True)
print(y)
# [    0.      1.5  1500. ]

他のオプションについては、set_printoptionsドキュメントを参照してください。


NumPy 1.15.0以降を使用して印刷オプションをローカル適用するには、numpy.printoptionsコンテキストマネージャーを使用できます。たとえば、with-suite precision=3およびの内部suppress=Trueが設定されています:

x = np.random.random(10)
with np.printoptions(precision=3, suppress=True):
    print(x)
    # [ 0.073  0.461  0.689  0.754  0.624  0.901  0.049  0.582  0.557  0.348]

ただしwith-suite、印刷オプション以外はデフォルト設定に戻ります。

print(x)    
# [ 0.07334334  0.46132615  0.68935231  0.75379645  0.62424021  0.90115836
#   0.04879837  0.58207504  0.55694118  0.34768638]

以前のバージョンのNumPyを使用している場合は、自分でコンテキストマネージャを作成できます。例えば、

import numpy as np
import contextlib

@contextlib.contextmanager
def printoptions(*args, **kwargs):
    original = np.get_printoptions()
    np.set_printoptions(*args, **kwargs)
    try:
        yield
    finally: 
        np.set_printoptions(**original)

x = np.random.random(10)
with printoptions(precision=3, suppress=True):
    print(x)
    # [ 0.073  0.461  0.689  0.754  0.624  0.901  0.049  0.582  0.557  0.348]

フロートの端からゼロが取り除かれるのを防ぐには:

np.set_printoptionsには、formatter各タイプのフォーマット関数を指定できるパラメーターがあります。

np.set_printoptions(formatter={'float': '{: 0.3f}'.format})
print(x)

印刷する

[ 0.078  0.480  0.413  0.830  0.776  0.102  0.513  0.462  0.335  0.712]

の代わりに

[ 0.078  0.48   0.413  0.83   0.776  0.102  0.513  0.462  0.335  0.712]

すべての印刷ステートメントで使用される一般的な出力フォーマットを設定するのではなく)特定の印刷ステートメントのみにフォーマットを適用する手段はありますか?
bph 2013年

7
@Hiett:1つだけの印刷オプションを設定するNumPy関数はありませprintんが、コンテキストマネージャーを使用して同様のものを作成できます。上記の投稿を編集して、意味を示しました。
unutbu 2013年

2
あなたnp.set_printoptions(precision=3)はエンドゼロを抑制します..どのようにしてそれらをこのように表示させるの[ 0.078 0.480 0.413 0.830 0.776 0.102 0.513 0.462 0.335 0.712]ですか?
Norfeldt 2013

2
@Norfeldt:上記の方法を追加しました。
unutbu 2013

1
これはうまくいきます。補足として、set_printoptions文字列表現が必要で必ずしもを使用する必要がない場合にも使用できますprint__str__()numpy配列インスタンスを呼び出すだけで、設定した印刷オプションに従ってフォーマットされた文字列を取得できます。
Jayesh、2015年

40

コマンドnp.set_printoptionsから機能のサブセットを取得できますnp.array_str。これは、単一の印刷ステートメントにのみ適用されます。

http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.array_str.html

例えば:

In [27]: x = np.array([[1.1, 0.9, 1e-6]]*3)

In [28]: print x
[[  1.10000000e+00   9.00000000e-01   1.00000000e-06]
 [  1.10000000e+00   9.00000000e-01   1.00000000e-06]
 [  1.10000000e+00   9.00000000e-01   1.00000000e-06]]

In [29]: print np.array_str(x, precision=2)
[[  1.10e+00   9.00e-01   1.00e-06]
 [  1.10e+00   9.00e-01   1.00e-06]
 [  1.10e+00   9.00e-01   1.00e-06]]

In [30]: print np.array_str(x, precision=2, suppress_small=True)
[[ 1.1  0.9  0. ]
 [ 1.1  0.9  0. ]
 [ 1.1  0.9  0. ]]

37

Unutbuは本当に完全な答えを出しました(彼らも私から+1をもらいました)が、ここにlo-techの選択肢があります:

>>> x=np.random.randn(5)
>>> x
array([ 0.25276524,  2.28334499, -1.88221637,  0.69949927,  1.0285625 ])
>>> ['{:.2f}'.format(i) for i in x]
['0.25', '2.28', '-1.88', '0.70', '1.03']

関数として(format()書式設定の構文を使用):

def ndprint(a, format_string ='{0:.2f}'):
    print [format_string.format(v,i) for i,v in enumerate(a)]

使用法:

>>> ndprint(x)
['0.25', '2.28', '-1.88', '0.70', '1.03']

>>> ndprint(x, '{:10.4e}')
['2.5277e-01', '2.2833e+00', '-1.8822e+00', '6.9950e-01', '1.0286e+00']

>>> ndprint(x, '{:.8g}')
['0.25276524', '2.283345', '-1.8822164', '0.69949927', '1.0285625']

配列のインデックスには、フォーマット文字列でアクセスできます。

>>> ndprint(x, 'Element[{1:d}]={0:.2f}')
['Element[0]=0.25', 'Element[1]=2.28', 'Element[2]=-1.88', 'Element[3]=0.70', 'Element[4]=1.03']

15

FYI Numpy 1.15(リリース日は未定)には、印刷オプションをローカルに設定するためのコンテキストマネージャー含まれます。つまり、独自のコンテキストマネージャーを作成しなくても、次のコードは(unutbuおよびNeil Gによる)承認された回答の対応する例と同じように機能します。例えば、彼らの例を使用して:

x = np.random.random(10)
with np.printoptions(precision=3, suppress=True):
    print(x)
    # [ 0.073  0.461  0.689  0.754  0.624  0.901  0.049  0.582  0.557  0.348]

12

文字列として結果を取得するのが非常に簡単になる宝石(今日の厄介なバージョン)はdenisの回答に隠されています。 np.array2string

>>> import numpy as np
>>> x=np.random.random(10)
>>> np.array2string(x, formatter={'float_kind':'{0:.3f}'.format})
'[0.599 0.847 0.513 0.155 0.844 0.753 0.920 0.797 0.427 0.420]'

8

数年後、別のものが下にあります。しかし、毎日の使用のために私はちょうど

np.set_printoptions( threshold=20, edgeitems=10, linewidth=140,
    formatter = dict( float = lambda x: "%.3g" % x ))  # float arrays %.3g

''' printf( "... %.3g ... %.1f  ...", arg, arg ... ) for numpy arrays too

Example:
    printf( """ x: %.3g   A: %.1f   s: %s   B: %s """,
                   x,        A,        "str",  B )

If `x` and `A` are numbers, this is like `"format" % (x, A, "str", B)` in python.
If they're numpy arrays, each element is printed in its own format:
    `x`: e.g. [ 1.23 1.23e-6 ... ]  3 digits
    `A`: [ [ 1 digit after the decimal point ... ] ... ]
with the current `np.set_printoptions()`. For example, with
    np.set_printoptions( threshold=100, edgeitems=3, suppress=True )
only the edges of big `x` and `A` are printed.
`B` is printed as `str(B)`, for any `B` -- a number, a list, a numpy object ...

`printf()` tries to handle too few or too many arguments sensibly,
but this is iffy and subject to change.

How it works:
numpy has a function `np.array2string( A, "%.3g" )` (simplifying a bit).
`printf()` splits the format string, and for format / arg pairs
    format: % d e f g
    arg: try `np.asanyarray()`
-->  %s  np.array2string( arg, format )
Other formats and non-ndarray args are left alone, formatted as usual.

Notes:

`printf( ... end= file= )` are passed on to the python `print()` function.

Only formats `% [optional width . precision] d e f g` are implemented,
not `%(varname)format` .

%d truncates floats, e.g. 0.9 and -0.9 to 0; %.0f rounds, 0.9 to 1 .
%g is the same as %.6g, 6 digits.
%% is a single "%" character.

The function `sprintf()` returns a long string. For example,
    title = sprintf( "%s  m %g  n %g  X %.3g",
                    __file__, m, n, X )
    print( title )
    ...
    pl.title( title )

Module globals:
_fmt = "%.3g"  # default for extra args
_squeeze = np.squeeze  # (n,1) (1,n) -> (n,) print in 1 line not n

See also:
http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.set_printoptions.html
http://docs.python.org/2.7/library/stdtypes.html#string-formatting

'''
# http://stackoverflow.com/questions/2891790/pretty-printing-of-numpy-array


#...............................................................................
from __future__ import division, print_function
import re
import numpy as np

__version__ = "2014-02-03 feb denis"

_splitformat = re.compile( r'''(
    %
    (?<! %% )  # not %%
    -? [ \d . ]*  # optional width.precision
    \w
    )''', re.X )
    # ... %3.0f  ... %g  ... %-10s ...
    # -> ['...' '%3.0f' '...' '%g' '...' '%-10s' '...']
    # odd len, first or last may be ""

_fmt = "%.3g"  # default for extra args
_squeeze = np.squeeze  # (n,1) (1,n) -> (n,) print in 1 line not n

#...............................................................................
def printf( format, *args, **kwargs ):
    print( sprintf( format, *args ), **kwargs )  # end= file=

printf.__doc__ = __doc__


def sprintf( format, *args ):
    """ sprintf( "text %.3g text %4.1f ... %s ... ", numpy arrays or ... )
        %[defg] array -> np.array2string( formatter= )
    """
    args = list(args)
    if not isinstance( format, basestring ):
        args = [format] + args
        format = ""

    tf = _splitformat.split( format )  # [ text %e text %f ... ]
    nfmt = len(tf) // 2
    nargs = len(args)
    if nargs < nfmt:
        args += (nfmt - nargs) * ["?arg?"]
    elif nargs > nfmt:
        tf += (nargs - nfmt) * [_fmt, " "]  # default _fmt

    for j, arg in enumerate( args ):
        fmt = tf[ 2*j + 1 ]
        if arg is None \
        or isinstance( arg, basestring ) \
        or (hasattr( arg, "__iter__" ) and len(arg) == 0):
            tf[ 2*j + 1 ] = "%s"  # %f -> %s, not error
            continue
        args[j], isarray = _tonumpyarray(arg)
        if isarray  and fmt[-1] in "defgEFG":
            tf[ 2*j + 1 ] = "%s"
            fmtfunc = (lambda x: fmt % x)
            formatter = dict( float_kind=fmtfunc, int=fmtfunc )
            args[j] = np.array2string( args[j], formatter=formatter )
    try:
        return "".join(tf) % tuple(args)
    except TypeError:  # shouldn't happen
        print( "error: tf %s  types %s" % (tf, map( type, args )))
        raise


def _tonumpyarray( a ):
    """ a, isarray = _tonumpyarray( a )
        ->  scalar, False
            np.asanyarray(a), float or int
            a, False
    """
    a = getattr( a, "value", a )  # cvxpy
    if np.isscalar(a):
        return a, False
    if hasattr( a, "__iter__" )  and len(a) == 0:
        return a, False
    try:
        # map .value ?
        a = np.asanyarray( a )
    except ValueError:
        return a, False
    if hasattr( a, "dtype" )  and a.dtype.kind in "fi":  # complex ?
        if callable( _squeeze ):
            a = _squeeze( a )  # np.squeeze
        return a, True
    else:
        return a, False


#...............................................................................
if __name__ == "__main__":
    import sys

    n = 5
    seed = 0
        # run this.py n= ...  in sh or ipython
    for arg in sys.argv[1:]:
        exec( arg )
    np.set_printoptions( 1, threshold=4, edgeitems=2, linewidth=80, suppress=True )
    np.random.seed(seed)

    A = np.random.exponential( size=(n,n) ) ** 10
    x = A[0]

    printf( "x: %.3g  \nA: %.1f  \ns: %s  \nB: %s ",
                x,         A,         "str",   A )
    printf( "x %%d: %d", x )
    printf( "x %%.0f: %.0f", x )
    printf( "x %%.1e: %.1e", x )
    printf( "x %%g: %g", x )
    printf( "x %%s uses np printoptions: %s", x )

    printf( "x with default _fmt: ", x )
    printf( "no args" )
    printf( "too few args: %g %g", x )
    printf( x )
    printf( x, x )
    printf( None )
    printf( "[]:", [] )
    printf( "[3]:", [3] )
    printf( np.array( [] ))
    printf( [[]] )  # squeeze

6

そして、これが私が使用するものであり、かなり複雑ではありません:

print(np.vectorize("%.2f".__mod__)(sparse))

3

around記載されている方法が表示されないことに驚いた-印刷オプションをいじる必要がないことを意味します。

import numpy as np

x = np.random.random([5,5])
print(np.around(x,decimals=3))

Output:
[[0.475 0.239 0.183 0.991 0.171]
 [0.231 0.188 0.235 0.335 0.049]
 [0.87  0.212 0.219 0.9   0.3  ]
 [0.628 0.791 0.409 0.5   0.319]
 [0.614 0.84  0.812 0.4   0.307]]

2

さまざまな列にさまざまな形式を設定することがよくあります。これは、NumPy配列(のスライス)をタプルに変換することで、さまざまなフォーマットを使用して単純な2D配列を出力する方法です。

import numpy as np
dat = np.random.random((10,11))*100  # Array of random values between 0 and 100
print(dat)                           # Lines get truncated and are hard to read
for i in range(10):
    print((4*"%6.2f"+7*"%9.4f") % tuple(dat[i,:]))

1

numpy.char.modたとえば、アプリケーションの詳細によっては、numpy.char.mod('Value=%4.2f', numpy.arange(5, 10, 0.1))「値= 5.00」、「値= 5.10」などの要素を含む文字列配列を返す場合もあります(やや工夫された例として)。


1

numpy配列には、round(precision)それに応じて要素が丸められた新しいnumpy配列を返すメソッドがあります。

import numpy as np

x = np.random.random([5,5])
print(x.round(3))

1
これは、配列をmatplotlib ylabelに渡すときにうまくいきました。ありがとう
Hans

1

ループを使用してリストまたは配列を表示すると、通常の浮動小数点形式{:9.5f}が適切に機能し、小さな値のe表記が抑制されます。ただし、フォーマッターが1つの印刷ステートメントに複数の項目を持っている場合、そのフォーマットはe表記を抑制できないことがあります。例えば:

import numpy as np
np.set_printoptions(suppress=True)
a3 = 4E-3
a4 = 4E-4
a5 = 4E-5
a6 = 4E-6
a7 = 4E-7
a8 = 4E-8
#--first, display separate numbers-----------
print('Case 3:  a3, a4, a5:             {:9.5f}{:9.5f}{:9.5f}'.format(a3,a4,a5))
print('Case 4:  a3, a4, a5, a6:         {:9.5f}{:9.5f}{:9.5f}{:9.5}'.format(a3,a4,a5,a6))
print('Case 5:  a3, a4, a5, a6, a7:     {:9.5f}{:9.5f}{:9.5f}{:9.5}{:9.5f}'.format(a3,a4,a5,a6,a7))
print('Case 6:  a3, a4, a5, a6, a7, a8: {:9.5f}{:9.5f}{:9.5f}{:9.5f}{:9.5}{:9.5f}'.format(a3,a4,a5,a6,a7,a8))
#---second, display a list using a loop----------
myList = [a3,a4,a5,a6,a7,a8]
print('List 6:  a3, a4, a5, a6, a7, a8: ', end='')
for x in myList: 
    print('{:9.5f}'.format(x), end='')
print()
#---third, display a numpy array using a loop------------
myArray = np.array(myList)
print('Array 6: a3, a4, a5, a6, a7, a8: ', end='')
for x in myArray:
    print('{:9.5f}'.format(x), end='')
print()

私の結果は、ケース4、5、および6のバグを示しています。

Case 3:  a3, a4, a5:               0.00400  0.00040  0.00004
Case 4:  a3, a4, a5, a6:           0.00400  0.00040  0.00004    4e-06
Case 5:  a3, a4, a5, a6, a7:       0.00400  0.00040  0.00004    4e-06  0.00000
Case 6:  a3, a4, a5, a6, a7, a8:   0.00400  0.00040  0.00004  0.00000    4e-07  0.00000
List 6:  a3, a4, a5, a6, a7, a8:   0.00400  0.00040  0.00004  0.00000  0.00000  0.00000
Array 6: a3, a4, a5, a6, a7, a8:   0.00400  0.00040  0.00004  0.00000  0.00000  0.00000

私はこれについての説明がないので、私は常に複数の値の浮動出力にループを使用します。


1

私が使う

def np_print(array,fmt="10.5f"):
    print (array.size*("{:"+fmt+"}")).format(*array)

多次元配列用に変更することは難しくありません。


0

さらに別のオプションは、decimalモジュールを使用することです:

import numpy as np
from decimal import *

arr = np.array([  56.83,  385.3 ,    6.65,  126.63,   85.76,  192.72,  112.81, 10.55])
arr2 = [str(Decimal(i).quantize(Decimal('.01'))) for i in arr]

# ['56.83', '385.30', '6.65', '126.63', '85.76', '192.72', '112.81', '10.55']
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