DISPLAYが定義されていないときにmatplotlibを使用してPNGを生成する

Pythonでnetworkxを使用しようとしています。このプログラムを実行すると、このエラーが発生します。不足しているものはありますか？

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

今、別のエラーが出ます：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

今、別のエラーが出ます：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

主な問題は、（システム上で）matplotlibがデフォルトでxを使用するバックエンドを選択することです。サーバーの1つで同じ問題が発生しました。私のための解決策は、他のpylab / matplotlib / pyplotインポートの前に読み込まれる場所に次のコードを追加することでした：

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

代替方法は、.matplotlibrcに設定することです

ラインアウトの答えを補完するものとして。

この種の問題を解決する永続的な方法は、.matplotlibrcファイルを編集することです。経由してそれを見つける

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

次に、そのファイルのバックエンドをに変更しますbackend : Agg。それだ。

明確な答えは、実行環境を正しく準備するために少し時間をかけることです。

実行環境を準備するために必要な最初の手法は、Chris Qが賢明に推奨しているように、matplotlibrcファイルを使用することです。設定

backend : Agg

そのファイルで。コードを変更することなく、matplotlibがmatplotlibrcファイルを検索する方法と場所を制御することもできます。

実行環境を準備するために必要な2番目の手法は、MPLBACKEND環境変数を使用することです（そして、環境変数を使用するようユーザーに通知します）。

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

これを機能させるためにディスクに別のファイルを用意する必要がないので、これは便利です。私はこのアプローチを採用しており、たとえば、継続的インテグレーションでのテストや、ディスプレイのないリモートマシンでの実行などがあります。

Pythonコードでmatplotlibバックエンドを "Agg"にハードコーディングすることは、正方形のペグを大きなハンマーで丸い穴に打ち込むようなものです。

Sparkからmatplotlibを使用しているときにエラーが発生しました。matplotlib.use('Agg')うまくいきません。結局、次のコードは私にとってはうまくいきます。詳細はこちら

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

見落とされがちな@Ivo Bostickyの発言を繰り返します。で、これらの行を入れて非常に PYファイルの開始。

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

またはエラーが発生します

* / usr / lib / pymodules / python2.7 / matplotlib / __ init__.py:923：UserWarning：このmatplotlib.use（）の呼び出しは効果がありません
バックエンドがすでに選択されているため。
matplotlib.use（）はpylab、matplotlib.pyplot、*の前に呼び出す必要があります*

これですべてのディスプレイの問題が解決します

このスニペットは、X環境と非X環境を切り替えるときにうまく機能することがわかりました。

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

サーバーにサインインしてコードを実行する場合は、代わりにこれを使用します。

ssh -X username@servername

これ-Xにより、表示名と$ DISPLAY環境変数エラーがなくなります。

:)

どのシステムを使用していますか？X11のシステムがあるようですが、DISPLAY環境変数が正しく設定されていません。次のコマンドを実行してから、プログラムを再実行してください。

export DISPLAY=localhost:0

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

わたしにはできる。

チェックするもう1つのことは、現在のユーザーがXディスプレイへの接続を許可されているかどうかです。私の場合、rootはそれを許可されておらず、matplotlibも同じエラーで不満を言っていました。

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

ソース：http ：//www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

コードがWindows、Linux、OSX間で移植可能であることを確認し、ディスプレイのあるシステムとないシステムの場合、次のスニペットをお勧めします。

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

クレジット：https : //stackoverflow.com/a/45756291/207661

Google Cloud Machine Learning Engineの場合：

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

そして、ファイルに出力するには：

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

PDFを作成するには：

multi_page(report_name)