大きなパンダのデータフレームを分割する


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423244行の大きなデータフレームがあります。これを4つに分割したいのですが、エラーが発生した次のコードを試しましたか?ValueError: array split does not result in an equal division

for item in np.split(df, 4):
    print item

このデータフレームを4つのグループに分割するにはどうすればよいですか?


私たちは、欲しいnp.split(df, N)機能をしてください。
ソレン

回答:


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使用np.array_split

Docstring:
Split an array into multiple sub-arrays.

Please refer to the ``split`` documentation.  The only difference
between these functions is that ``array_split`` allows
`indices_or_sections` to be an integer that does *not* equally
divide the axis.

In [1]: import pandas as pd

In [2]: df = pd.DataFrame({'A' : ['foo', 'bar', 'foo', 'bar',
   ...:                           'foo', 'bar', 'foo', 'foo'],
   ...:                    'B' : ['one', 'one', 'two', 'three',
   ...:                           'two', 'two', 'one', 'three'],
   ...:                    'C' : randn(8), 'D' : randn(8)})

In [3]: print df
     A      B         C         D
0  foo    one -0.174067 -0.608579
1  bar    one -0.860386 -1.210518
2  foo    two  0.614102  1.689837
3  bar  three -0.284792 -1.071160
4  foo    two  0.843610  0.803712
5  bar    two -1.514722  0.870861
6  foo    one  0.131529 -0.968151
7  foo  three -1.002946 -0.257468

In [4]: import numpy as np
In [5]: np.array_split(df, 3)
Out[5]: 
[     A    B         C         D
0  foo  one -0.174067 -0.608579
1  bar  one -0.860386 -1.210518
2  foo  two  0.614102  1.689837,
      A      B         C         D
3  bar  three -0.284792 -1.071160
4  foo    two  0.843610  0.803712
5  bar    two -1.514722  0.870861,
      A      B         C         D
6  foo    one  0.131529 -0.968151
7  foo  three -1.002946 -0.257468]

8
@ NilaniAlgiriyage-DataFrameのarray_splitリストを返すので、リストをループするだけです...
ルート

1
データフレームには「サイズ」がないため、どのようにしてAttributeErrorを取得しませんか。
Boosted_d16 2014年

2
この回答は古くなっています:AttributeError: 'DataFrame' object has no attribute 'size'
Tjorriemorrie 2015年

1
答えはうまくいきます!重い計算を行うときにデータフレームのチャンクをループするための非常にタイトで簡潔な(Pythonicなど)
openwonk 2017

1
驚くほどシンプル!おかげで
ヴィヴ

37

同じことをしたかったのですが、最初に分割機能に問題があり、次にパンダ0.15.2のインストールに問題があったので、古いバージョンに戻って、非常にうまく機能する小さな関数を作成しました。これがお役に立てば幸いです。

# input - df: a Dataframe, chunkSize: the chunk size
# output - a list of DataFrame
# purpose - splits the DataFrame into smaller chunks
def split_dataframe(df, chunk_size = 10000): 
    chunks = list()
    num_chunks = len(df) // chunk_size + 1
    for i in range(num_chunks):
        chunks.append(df[i*chunk_size:(i+1)*chunk_size])
    return chunks

6
np.array_split()を使用するよりもはるかに高速
jgaw 2016年

6
numberChunksを計算する正しい方法importmath numberChunks = math.ceil(len(df)/ chunkSize)
SergeyLeyko20年

21

これでプレーンilocを使用できるようになったと思いますrange

chunk_size = int(df.shape[0] / 4)
for start in range(0, df.shape[0], chunk_size):
    df_subset = df.iloc[start:start + chunk_size]
    process_data(df_subset)
    ....

1
シンプルで直感的な
rmstmppr

15

ことに注意してnp.array_split(df, 3)いる間、3つのサブデータフレームにデータフレームを分割split_dataframe機能は、で定義された@エリクシルの答えと呼ばれる、split_dataframe(df, chunk_size=3)、データフレームごとに分割されchunk_sizeた行を。

例:

np.array_split

df = pd.DataFrame([1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11], columns=['TEST'])
df_split = np.array_split(df, 3)

... 3つのサブデータフレームを取得します:

df_split[0] # 1, 2, 3, 4
df_split[1] # 5, 6, 7, 8
df_split[2] # 9, 10, 11

split_dataframe

df_split2 = split_dataframe(df, chunk_size=3)

... 4つのサブデータフレームを取得します:

df_split2[0] # 1, 2, 3
df_split2[1] # 4, 5, 6
df_split2[2] # 7, 8, 9
df_split2[3] # 10, 11

私が正しいこと、そしてこれが役立つことを願っています。


このプロセスをランダムにする簡単な方法はありますか?ランダムな列を追加し、ランダムな列を分割して削除することしか考えられませんが、もっと簡単な方法があるかもしれません
Rutger Hofste 2018

それらは等しいチャンクサイズである必要がありますか?
InquilineKea 2018年

8

注意:

np.array_splitnumpy-1.9.0では動作しません。チェックアウトしました:1.8.1で動作します。

エラー:

データフレームには「サイズ」属性がありません


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私はパンダのgithubにバグを報告しましたgithub.com/pydata/pandas/issues/8846 パンダ0.15.2用にすでに修正されているようです
yemu 2014

4

groupby整数の列挙型インデックスがあると仮定して、を使用できます。

import math
df = pd.DataFrame(dict(sample=np.arange(99)))
rows_per_subframe = math.ceil(len(df) / 4.)

subframes = [i[1] for i in df.groupby(np.arange(len(df))//rows_per_subframe)]

注:groupby2番目の要素がデータフレームであるタプルを返すため、抽出は少し複雑になります。

>>> len(subframes), [len(i) for i in subframes]
(4, [25, 25, 25, 24])

1

また、np.array_splitがPandas DataFrameで機能しないことも経験しました。私の解決策は、DataFrameのインデックスのみを分割してから、「group」ラベルの付いた新しい列を導入することでした。

indexes = np.array_split(df.index,N, axis=0)
for i,index in enumerate(indexes):
   df.loc[index,'group'] = i

これにより、各グループの平均値の計算など、グルービー操作が非常に便利になります。

df.groupby(by='group').mean()

1

リスト内包表記を使用して、これを1行で行うことができます

n = 4
chunks = [df[i:i+n] for i in range(0,df.shape[0],n)]
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