データフレームのグループ内の行に番号を付ける


163

次のようなデータフレームの操作:

set.seed(100)  
df <- data.frame(cat = c(rep("aaa", 5), rep("bbb", 5), rep("ccc", 5)), val = runif(15))             
df <- df[order(df$cat, df$val), ]  
df  

   cat        val  
1  aaa 0.05638315  
2  aaa 0.25767250  
3  aaa 0.30776611  
4  aaa 0.46854928  
5  aaa 0.55232243  
6  bbb 0.17026205  
7  bbb 0.37032054  
8  bbb 0.48377074  
9  bbb 0.54655860  
10 bbb 0.81240262  
11 ccc 0.28035384  
12 ccc 0.39848790  
13 ccc 0.62499648  
14 ccc 0.76255108  
15 ccc 0.88216552 

各グループ内に番号の付いた列を追加しようとしています。この方法で行うことは、明らかにRの機能を使用していません。

 df$num <- 1  
 for (i in 2:(length(df[,1]))) {  
   if (df[i,"cat"]==df[(i-1),"cat"]) {  
     df[i,"num"]<-df[i-1,"num"]+1  
     }  
 }  
 df  

   cat        val num  
1  aaa 0.05638315   1  
2  aaa 0.25767250   2  
3  aaa 0.30776611   3  
4  aaa 0.46854928   4  
5  aaa 0.55232243   5  
6  bbb 0.17026205   1  
7  bbb 0.37032054   2  
8  bbb 0.48377074   3  
9  bbb 0.54655860   4  
10 bbb 0.81240262   5  
11 ccc 0.28035384   1  
12 ccc 0.39848790   2  
13 ccc 0.62499648   3  
14 ccc 0.76255108   4  
15 ccc 0.88216552   5  

これを行うための良い方法は何でしょうか?


1
これは私がこの質問を見つけた方法であり、まさに私が探していたものなので、質問のタイトルに「seq along levels」または「counting along replicates」のようなものを追加することをお勧めします
crazysantaclaus

2
@crazysantaclausそれがタイトルだとしたら、探していたものが見つからなかったでしょう:-(文字通り「データフレーム内のグループ内の行に番号を
付ける

回答:


280

使用aveddplydplyrまたはdata.table

df$num <- ave(df$val, df$cat, FUN = seq_along)

または:

library(plyr)
ddply(df, .(cat), mutate, id = seq_along(val))

または:

library(dplyr)
df %>% group_by(cat) %>% mutate(id = row_number())

または(メモリ内で参照により割り当てられるため、最もメモリ効率が良いDT):

library(data.table)
DT <- data.table(df)

DT[, id := seq_len(.N), by = cat]
DT[, id := rowid(cat)]

2
aveここでは、intの代わりにfloat を与えることに言及する価値があるかもしれません。代わりに、変更される可能性df$valseq_len(nrow(df))。:私はこっちに走ったこのstackoverflow.com/questions/42796857/...
フランク・

1
興味深いことに、このdata.tableソリューションは、使用するよりも速くなるようだfranklibrary(microbenchmark); microbenchmark(a = DT[, .(val ,num = frank(val)), by = list(cat)] ,b =DT[, .(val , id = seq_len(.N)), by = list(cat)] , times = 1000L)
hannes101

4
ありがとう!dplyr解決策は良好です。私のように、あなたがこのアプローチをしようとしたときに変なエラーを取得保管、しかし、もしあなたが間の競合になっていないことを確認してくださいplyrdplyr説明したように、この記事では、明示的に呼び出すことによって、それを避けることができますdplyr::mutate(...)
EcologyTom

2
別のdata.table方法はsetDT(df)[, id:=rleid(val), by=.(cat)]
chinsoon12

ランキングval列を降順に変更library(plyr)してlibrary(dplyr)回答するにはどうすればよいですか?
Przemyslaw Remin

26

これを作るために 質問はより完全であり、sequenceandを使用したベースRの代替rle

df$num <- sequence(rle(df$cat)$lengths)

意図した結果が得られます:

> df
   cat        val num
4  aaa 0.05638315   1
2  aaa 0.25767250   2
1  aaa 0.30776611   3
5  aaa 0.46854928   4
3  aaa 0.55232243   5
10 bbb 0.17026205   1
8  bbb 0.37032054   2
6  bbb 0.48377074   3
9  bbb 0.54655860   4
7  bbb 0.81240262   5
13 ccc 0.28035384   1
14 ccc 0.39848790   2
11 ccc 0.62499648   3
15 ccc 0.76255108   4
12 ccc 0.88216552   5

df$catが因子変数の場合は、as.character最初にラップする必要があります。

df$num <- sequence(rle(as.character(df$cat))$lengths)

気づいたばかりですが、このソリューションではcat列をソートする必要がありますか?
zx8754

あなたが連続しoccurancesに基づいて数値にしたい場合を除きzx8754はい、@cat
ヤープ

9

for行ごとではなくグループごとのループを使用するオプションがあります(OPのように)

for (i in unique(df$cat)) df$num[df$cat == i] <- seq_len(sum(df$cat == i))

9

以下は、グループ内で「val」をソートできるようにする小さな改善策です。

# 1. Data set
set.seed(100)
df <- data.frame(
  cat = c(rep("aaa", 5), rep("ccc", 5), rep("bbb", 5)), 
  val = runif(15))             

# 2. 'dplyr' approach
df %>% 
  arrange(cat, val) %>% 
  group_by(cat) %>% 
  mutate(id = row_number())

group_byの後にソートできませんか?
zcoleman

6

私は、順序を変更する追加の可能性を提供し、ソリューションよりも少し柔軟にし、RDBMSのrow_number関数に非常に似data.tableているrank()関数を使用して、バリアントを追加したいseq_len()と思います。

# Variant with ascending ordering
library(data.table)
dt <- data.table(df)
dt[, .( val
   , num = rank(val))
    , by = list(cat)][order(cat, num),]

    cat        val num
 1: aaa 0.05638315   1
 2: aaa 0.25767250   2
 3: aaa 0.30776611   3
 4: aaa 0.46854928   4
 5: aaa 0.55232243   5
 6: bbb 0.17026205   1
 7: bbb 0.37032054   2
 8: bbb 0.48377074   3
 9: bbb 0.54655860   4
10: bbb 0.81240262   5
11: ccc 0.28035384   1
12: ccc 0.39848790   2
13: ccc 0.62499648   3
14: ccc 0.76255108   4

# Variant with descending ordering
dt[, .( val
   , num = rank(-val))
    , by = list(cat)][order(cat, num),]

5

別のdplyr可能性は次のとおりです。

df %>%
 group_by(cat) %>%
 mutate(num = 1:n())

   cat      val   num
   <fct>  <dbl> <int>
 1 aaa   0.0564     1
 2 aaa   0.258      2
 3 aaa   0.308      3
 4 aaa   0.469      4
 5 aaa   0.552      5
 6 bbb   0.170      1
 7 bbb   0.370      2
 8 bbb   0.484      3
 9 bbb   0.547      4
10 bbb   0.812      5
11 ccc   0.280      1
12 ccc   0.398      2
13 ccc   0.625      3
14 ccc   0.763      4
15 ccc   0.882      5

3
代わりに、いくつかのケースで1:n()使用してseq_len(n())操作のあなたの順序であなたは状況持っている場合には、より安全でn()返すことがありますが0あるため、1:0一方であなたは長さ2のベクトルを与えるseq_len(0)ためと長さの不一致エラーを回避、長さゼロのベクトルを与えますmutate()
ブライアンスタンパー

0

でのrowid()関数の使用data.table

> set.seed(100)  
> df <- data.frame(cat = c(rep("aaa", 5), rep("bbb", 5), rep("ccc", 5)), val = runif(15))
> df <- df[order(df$cat, df$val), ]  
> df$num <- data.table::rowid(df$cat)
> df
   cat        val num
4  aaa 0.05638315   1
2  aaa 0.25767250   2
1  aaa 0.30776611   3
5  aaa 0.46854928   4
3  aaa 0.55232243   5
10 bbb 0.17026205   1
8  bbb 0.37032054   2
6  bbb 0.48377074   3
9  bbb 0.54655860   4
7  bbb 0.81240262   5
13 ccc 0.28035384   1
14 ccc 0.39848790   2
11 ccc 0.62499648   3
15 ccc 0.76255108   4
12 ccc 0.88216552   5

1
回答ありがとうございます。@ mnelの回答の最後の提案ですでにカバーされているようです
eli-k
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