matplotlibに保存された画像の周りの空白を削除する

画像を取り、いくつかのプロセスの後に保存する必要があります。図を表示すると問題なく見えますが、図を保存した後、保存した画像の周りに空白ができました。私は方法の'tight'オプションを試しましたがsavefig、うまくいきませんでした。コード：

  import matplotlib.image as mpimg
  import matplotlib.pyplot as plt

  fig = plt.figure(1)
  img = mpimg.imread(path)
  plt.imshow(img)
  ax=fig.add_subplot(1,1,1)

  extent = ax.get_window_extent().transformed(fig.dpi_scale_trans.inverted())
  plt.savefig('1.png', bbox_inches=extent)

  plt.axis('off') 
  plt.show()

図でNetworkXを使用して基本的なグラフを描き、保存しようとしています。グラフがなくても機能することに気付きましたが、グラフを追加すると、保存した画像の周囲に空白ができます。

import matplotlib.image as mpimg
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_node(2)
G.add_node(3)
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(1,2)
pos = {1:[100,120], 2:[200,300], 3:[50,75]}

fig = plt.figure(1)
img = mpimg.imread("C:\\images\\1.jpg")
plt.imshow(img)
ax=fig.add_subplot(1,1,1)

nx.draw(G, pos=pos)

extent = ax.get_window_extent().transformed(fig.dpi_scale_trans.inverted())
plt.savefig('1.png', bbox_inches = extent)

plt.axis('off') 
plt.show()

私の「解決策」がなぜ、どのように機能するのかを正確に把握しているとは言えませんが、これは、白い余白のない2つの翼セクションの輪郭をPDFファイルにプロットするときに必要でした。（IPythonノートブック内で-plabフラグを指定してmatplotlibを使用したことに注意してください。）

plt.gca().set_axis_off()
plt.subplots_adjust(top = 1, bottom = 0, right = 1, left = 0, 
            hspace = 0, wspace = 0)
plt.margins(0,0)
plt.gca().xaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
plt.gca().yaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
plt.savefig("filename.pdf", bbox_inches = 'tight',
    pad_inches = 0)

私はこれのさまざまな部分を非アクティブ化しようとしましたが、これは常にどこかに白いマージンをもたらします。これを変更して、マージンの不足によって太い線が図の限界近くに剃られないようにすることもできます。

次のように設定してbbox_inches="tight"、空白のパディングを削除できますsavefig。

plt.savefig("test.png",bbox_inches='tight')

引数をbbox_inches文字列として入力する必要があります。おそらくこれが、以前は機能しなかった理由です。

可能な重複：

Matplotlibプロット：軸、凡例、空白の削除

matplotlib図のマージンを設定するにはどうすればよいですか？

matplotlibプロットの左マージンと右マージンを減らす

上記の答えを試してもうまくいかなかった後（そして他のスタックの投稿がたくさん）、最終的に私にとってうまくいったのはちょうど

plt.gca().set_axis_off()
plt.subplots_adjust(top = 1, bottom = 0, right = 1, left = 0, 
            hspace = 0, wspace = 0)
plt.margins(0,0)
plt.savefig("myfig.pdf")

重要なことに、これにはbboxやパディング引数は含まれません。

私はArvind Pereira（http://robotics.usc.edu/~ampereir/wordpress/?p=626）から何かを見つけ、私のために働いているように見えました：

plt.savefig(filename, transparent = True, bbox_inches = 'tight', pad_inches = 0)

次の関数には、上記のヨハネスの回答が組み込まれています。私はそれを複数の軸でテストしましたがplt.figure、plt.subplots()うまく動作します。

def save(filepath, fig=None):
    '''Save the current image with no whitespace
    Example filepath: "myfig.png" or r"C:\myfig.pdf" 
    '''
    import matplotlib.pyplot as plt
    if not fig:
        fig = plt.gcf()

    plt.subplots_adjust(0,0,1,1,0,0)
    for ax in fig.axes:
        ax.axis('off')
        ax.margins(0,0)
        ax.xaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
        ax.yaxis.set_major_locator(plt.NullLocator())
    fig.savefig(filepath, pad_inches = 0, bbox_inches='tight')

次のコードはこの仕事に最適です。

fig = plt.figure(figsize=[6,6])
ax = fig.add_subplot(111)
ax.imshow(data)
ax.axes.get_xaxis().set_visible(False)
ax.axes.get_yaxis().set_visible(False)
ax.set_frame_on(False)
plt.savefig('data.png', dpi=400, bbox_inches='tight',pad_inches=0)

私はこのシーケンスに従って、それは魅力のように働きました。

plt.axis("off")
fig=plt.imshow(image array,interpolation='nearest')
fig.axes.get_xaxis().set_visible(False)
fig.axes.get_yaxis().set_visible(False)
plt.savefig('destination_path.pdf',
    bbox_inches='tight', pad_inches=0, format='pdf', dpi=1200)

インチではなくピクセル単位で作業したい場合は、これで十分です。

加えて、通常必要なもの

from matplotlib.transforms import Bbox

次に、以下を使用できます。

my_dpi = 100 # Good default - doesn't really matter

# Size of output in pixels
h = 224
w = 224

fig, ax = plt.subplots(1, figsize=(w/my_dpi, h/my_dpi), dpi=my_dpi)

ax.set_position([0, 0, 1, 1]) # Critical!

# Do some stuff
ax.imshow(img)
ax.imshow(heatmap) # 4-channel RGBA
ax.plot([50, 100, 150], [50, 100, 150], color="red")

ax.axis("off")

fig.savefig("saved_img.png",
            bbox_inches=Bbox([[0, 0], [w/my_dpi, h/my_dpi]]),
            dpi=my_dpi)

私が見つけたはるかに簡単なアプローチは使用することplt.imsaveです：

    import matplotlib.pyplot as plt
    arr = plt.imread(path)
    plt.imsave('test.png', arr)

これを試してみてください。それは私の問題を解決しました。

import matplotlib.image as mpimg
img = mpimg.imread("src.png")
mpimg.imsave("out.png", img, cmap=cmap)

保存する内容を表示したい場合は、plt.tight_layout変換を使用することをお勧めします。これは、plt.savefig

import matplotlib as plt    
plt.plot([1,2,3], [1,2,3])
plt.tight_layout(pad=0)
plt.savefig('plot.png')

これは私にとっては、imshowでプロットされた配列をファイルに保存するのに役立ちます

import matplotlib.pyplot as plt

fig = plt.figure(figsize=(10,10))
plt.imshow(img) # your image here
plt.axis("off")
plt.subplots_adjust(top = 1, bottom = 0, right = 1, left = 0, 
        hspace = 0, wspace = 0)
plt.savefig("example2.png", box_inches='tight', dpi=100)
plt.show()