回答:
私がお勧めすることは、postflight関数を実行するインストールスクリプトを作成することです。この関数はJoomlaに組み込まれており、拡張機能のインストール後に実行されます。
次のようなものを使用できます:
function postflight($type, $parent)
{
    // We only need to perform this if the extension is being installed, not updated
    if (strtolower($type) === 'install') 
    {       
        $db = JFactory::getDbo();
        $query = $db->getQuery(true);
        $fields = array(
            $db->quoteName('enabled') . ' = 1',
            $db->quoteName('ordering') . ' = 9999'
        );
        $conditions = array(
            $db->quoteName('element') . ' = ' . $db->quote('plg_myplugin'), 
            $db->quoteName('type') . ' = ' . $db->quote('plugin')
        );
        $query->update($db->quoteName('#__extensions'))->set($fields)->where($conditions);
        $db->setQuery($query);   
        $db->execute();     
    }
}
スクリプトファイルの詳細については、Joomlaドキュメントをお読みください。
http://docs.joomla.org/J2.5:Managing_Component_Updates_(Script.php)
お役に立てれば
次のようなプラグインを作成できます。
class plgExtensionEnableMyPlugins extends JPlugin
{
    public function onExtensionAfterInstall($installer, $eid)
    {
        if ($eid)
        {
            $db = JFactory::getDbo();
            $db->setQuery("UPDATE #__extensions SET `enabled` = 1 WHERE `extension_id` = $eid AND `type` = 'plugin'");
            $db->execute();
        }
    }
}
プラグインをインストールする前に、上記のプラグインをインストールして有効にします。
postflightは、すべてのプラグインの関数を作成するのではなく、プラグインを使用することを好みます。やり過ぎではないと思います。すべてのプラグインをインストールしたらすぐに、プラグインをアンインストール/無効化できます。これが同様のケースの人々を助けることを願っています。
                    
1し、9999整数であり、型キャストのための必要はありません。)