PostGIS：OGRでジオメトリWKBを解析

LineStringPostGISからジオメトリを引き出してOGR（python bindinds）で解析しようとしています。

from osgeo import ogr
import psycopg2

connection = psycopg2.connect("...")
cursor = connection.cursor()

query = "SELECT geom FROM points LIMIT 1"

cursor.execute(query)
row = cursor.fetchone()

wkb = row[0]
geom = ogr.CreateGeometryFromWkb(wkb)

cursor.close()
connection.close()

私はもう試した：

wkb = bin(int(row[0], 16))

そして：

SELECT ST_AsEWKB(geom) FROM points LIMIT 1

OGRはそれを解析したくありません。次のエラーを出し続けます：

ERROR 3: OGR Error: Unsupported geometry type

内部的には、PostGISはジオメトリをバイナリ仕様で格納しますが、クエリされ、外部で16進エンコードされた文字列として表示されます。よく知られているバイナリ（WKB）の 2つの一般的なバリエーションがあります。

• EWKB（経由ST_AsEWKB）-PostGIS によって設計された拡張WKB仕様。
• OGC WKB（via ST_AsBinary）-OGCおよびISOによって指定されています。それは2次元のみであったが、後にサポートするように拡張しながらためZ、MおよびZMジオメトリ。

2つの仕様は2Dジオメトリの場合と同じですがZ、MとZM座標を持つ高次のジオメトリでは異なります。

古いバージョンのGDAL / OGR（1.x）は、3DジオメトリのEWKBしか理解しないため、これらのバージョンではを使用することをお勧めしST_AsEWKBます。（ただし、2Dジオメトリしかない場合は、どちらの形式でも問題ありません）。例えば：

import psycopg2
from osgeo import ogr

ogr.UseExceptions()    
conn = psycopg2.connect('dbname=postgis user=postgres')
curs = conn.cursor()

curs.execute("select ST_AsEWKB('POINT Z (1 2 3)'::geometry) AS g")
b = bytes(curs.fetchone()[0])
print(b.encode('hex'))  # 0101000080000000000000f03f00000000000000400000000000000840
g = ogr.CreateGeometryFromWkb(b)
print(g.ExportToWkt())  # POINT (1 2 3)

curs.execute("select ST_AsBinary('POINT Z (1 2 3)'::geometry) AS g")
b = bytes(curs.fetchone()[0])
print(b.encode('hex'))  # 01e9030000000000000000f03f00000000000000400000000000000840
g = ogr.CreateGeometryFromWkb(b)
# RuntimeError: OGR Error: Unsupported geometry type

また、古いGDAL / OGRバージョンはM座標をサポートしていないため、これらは解析されますが無視されます。

GDAL 2.0以降では、ISO WKT / WKBがサポートされています。つまり、CreateGeometryFromWkbどちらのWKBフレーバーも（指定せずに）読み取ることができExportToIsoWkt()、最新のWKT構文で出力を表示します。

import psycopg2
from osgeo import ogr

ogr.UseExceptions()
conn = psycopg2.connect('dbname=postgis user=postgres')
curs = conn.cursor()

curs.execute("select ST_AsEWKB('POINT Z (1 2 3)'::geometry) AS g")
b = bytes(curs.fetchone()[0])
print(b.encode('hex'))  # 0101000080000000000000f03f00000000000000400000000000000840
g = ogr.CreateGeometryFromWkb(b)
print(g.ExportToIsoWkt())  # POINT Z (1 2 3)

curs.execute("select ST_AsBinary('POINT Z (1 2 3)'::geometry) AS g")
b = bytes(curs.fetchone()[0])
print(b.encode('hex'))  # 01e9030000000000000000f03f00000000000000400000000000000840
g = ogr.CreateGeometryFromWkb(b)
print(g.ExportToIsoWkt())  # POINT Z (1 2 3)

また、GDAL 2.1以降が作成されます/エクスポートWKT /とWKB MまたはZM座標を予想通り。

データベース内では、ジオメトリはPostGISプログラムでのみ使用される形式でディスクに保存されます。外部プログラムが有用なジオメトリを挿入および取得するには、それらを他のアプリケーションが理解できる形式に変換する必要があります。さいわい、PostGISは多数のフォーマットでジオメトリの放出と消費をサポートしています。

以下からの紹介のPostGISへ

WKB形式の場合：

既知のバイナリ（WKB）：
ST_GeomFromWKB（bytea）はジオメトリを返します
ST_AsBinary（geometry）はbyteaを返します
ST_AsEWKB（geometry）はbyteaを返します

ogrは、byteaの結果ではなくジオメトリを認識します（ST_AsEWKB()）

# result -> bytea format:
query = "SELECT ST_AsEWKB(geom) FROM points LIMIT 1"
# result -> geometry from bytea:
query = "SELECT ST_GeomFromWKB(ST_AsEWKB(geom)) from points LIMIT 1;"

テーブルの1つでテストします。

何も：

query = """SELECT ST_AsText(ST_AsEWKB(geom)) from mytable;"""
cur = conn.cursor()
cur.execute(query)
row = cur.fetchone()
print row[0]
'01010000208A7A0000DD2571661A9B10410CCD751AEBF70241'

とジオメトリ：

query = """SELECT ST_AsText(ST_GeomFromWKB(ST_AsEWKB(geom))) from mytable;"""
# result
cur.execute(query)
row = cur.fetchone()
print row
('POINT(272070.600041 155389.38792)',)

だから、試してみましょう：

 query = """SELECT ST_AsText(ST_GeomFromWKB(ST_AsEWKB(geom))) from mytable;"""
 cur = conn.cursor()
 cur.execute(query)
 row = cur.fetchone()    
 wkb = row[0];
 geom = ogr.CreateGeometryFromWkb(wkb)
 ERROR 3: OGR Error: Unsupported geometry type

どうして ？

クエリの結果が文字列であるため：

'01010000208A7A0000DD2571661A9B10410CCD751AEBF70241'

バイトコードではありません。

この文字列をデコードする必要があります（Python GDAL / OGRクックブックの WKBからジオメトリを作成するをご覧ください）。

そのため、使用がはるかに簡単です。

1）その他の出力形式（WKT、GeoJSONなど）

 query = """SELECT ST_AsGeoJSON(geom) from mytable;"""  
 cur.execute(query)
 row = cur.fetchone()
 point = ogr.CreateGeometryFromJson(row[0])
 print "%d,%d" % (point.GetX(), point.GetY())
 272070,155389

2）直接osgeo.ogr（たとえば、PythonでPostGISテーブルをShapefileに変換する方法？）

を使用ST_AsBinary(geom)して、ジオメトリをPostGIS内部形式からogrで読み取れるWKBに変換します。

cur.execute('SELECT ST_AsBinary(geom) FROM mytable LIMIT 1')
result = cur.fetchone()

Postgresの用語では、結果はbyteaです。psycpopg2ライブラリは、これをmemoryviewPythonタイプにマッピングします。

>>>> type(result[0])
<class 'memoryview'>

ちょうどあなたをキャストmemoryviewするbytesOGRとWKBを読むために：

>>>>geom = ogr.CreateGeometryFromWkb(bytes(result[0]))
<osgeo.ogr.Geometry; proxy of <Swig Object of type 'OGRGeometryShadow *' at 0x0000000002D179F0> >

数値の精度が気になる場合は、絶対にを使用しないでくださいST_AsText()。この関数は、ジオメトリをWKTに変換し、PostGISのバージョンとプラットフォームに応じた精度で座標を切り捨てます。