Rを使用してファイルジオデータベースを読み取りますか？

ファイルジオデータベース（fgdb）には、多数のファイルジオデータベーステーブルが含まれています。私の知る限り、それらはdbfファイルとして存在しますが、内にありDatabase.gdbます。

ArcCatalogでは、ファイルパスウェイはに似ていC:\Users\...\Database.gdb\Stats_AAます。

これらすべてのdbfファイルをR（統計ソフトウェア）に読み込む方法は？供給する正しい経路は何ですか？使用される関数はread.dbf（外部パッケージ内）です。

のバリアント

test<-read.dbf(file="C:/Users..Database.gdb/Stats_AA.dbf")

そして

test<-read.dbf(file="C:/Users..Database/Stats_AA.dbf")

動作しません。使用するファイル名の正しい「フォーム」とは何ですか、またはすべてのファイルジオデータベーステーブルを他のフォームまたは場所にエクスポートする必要がありますか？

r file-geodatabase

— ナン
ソース

ジオデータベースは、dbfではなくblobフィールドにジオメトリを格納します（シェープファイルは格納します）。

— マッパーズ

Esriのoledbプロバイダーをファイルジオデータベースに使用することをお勧めしますが、Rはoledbを読み取れないようです。その質問をupvoteしたい、ともあります。この1。

— カーククイケンドール

回答:

簡単な解決策は、Table to dBase（複数）を使用してテーブルをエクスポートすることです（右クリックFGDB>エクスポート> To dBase（複数）。このツールを使用して、FGDBフィーチャクラスに含まれる属性テーブルをエクスポートすることもできます。または、ツールにフィーチャクラスを追加し、出力フォルダーを指定しますもちろん、Rを使用して、新しいdBaseファイルを含むフォルダーをループできます。

ここに画像の説明を入力してください

— アーロン
ソース

これは機能します-ドロップダウンメニューは同じようには見えません（申し訳ありませんが、ArcMapファイルシステムを完全に理解していません）が、目次のテーブルエントリ自体を右クリックしてテーブルをエクスポートできることがわかりました読み取り可能な.dbfファイルを生成します。ありがとう！

— ナン

ファイルジオデータベースは、データをdbfとして保存しませんが、シェープファイルは保存します。FGDBは独自の内部ストレージメソッドを使用します。

ESRIはAPIを公開しました。これを使用してファイルジオデータベースサポートを使用してGDALをコンパイルすると、Rのgdalプラグインを使用してその方法でデータにアクセスできる場合があります。ただし、おそらく最も簡単な解決策は、データをシェープファイルに変換することです。その後、Rのdbfツールを使用できます。

— HeyOverThere
ソース

または、フィーチャクラス全体を変換するのではなく、属性テーブルをdbfとしてエクスポートするだけです。

— バルトーク

それは本当です！Xtoolsツールバーを使用して、属性テーブルをExcelに直接エクスポートすることもできます。ツールバーの無料版には、Excelエクスポート機能が含まれています。 xtoolspro.com

— HeyOverThere

@ HeyOverThere-ご指摘いただきありがとうございます。これらのテーブルは「ファイルジオデータベーステーブル」であり、.dbfファイルとして見つからなかった理由を説明しています。Aaronのエクスポートアプローチを使用しますが、すべてのデータをシェープファイルに変換するには時間がかかります。

— ナン

APIリンクが無効になっているようです。更新していただけますか？

— アーロン

ESRIがハウスクリーニングを行ったようです。リンクの新しい場所を指すように更新

— HeyOverThere

私は同じ問題に遭遇しました。私の意見では、ArcMapを使用するのは不便です。代わりに、次のコードを使用してRからpythonを呼び出しました。残念ながら、Arcpyが必要です。

Pythonスクリプト：

import os,sys
import arcpy
from arcpy import env
from sys import argv ### This is needed to import variables

script, featureClass, inFeatures, outLocation, outFeatureClass = argv
env.workspace = featureClass ### set working directory
arcpy.FeatureClassToFeatureClass_conversion(inFeatures, outLocation,outFeatureClass)

Rコード：

script = "./Path To Python Script/Example.py"
featureClass = './Path To Geodatabase/Example.gdb'
inFeatures = "featureClass"
outLocation = "./Path To Outfile Location"
outFeatureClass = "test.shp"
system2('python', args = c(shQuote(script),shQuote(featureClass),shQuote(inFeatures),shQuote(outLocation),shQuote(outFeatureClass)))

上記はジオデータベースからシェープファイルを出力します。その後、Rにインポートする必要があります。

— user44796
ソース