NumPyなしでOGRポイントの下でGDALラスターのピクセル値を取得しますか？

私は、風景全体の野生の花粉媒介者の豊富さの計算モデルに取り組んでいます。モデル自体は完成しており、私は現在、後処理ステップに苦労しています。

次のようなGDAL受粉器供給ラスターがあります（明るい色は、受粉器への訪問回数が多いことを意味します）。

そして、ランドスケープ上のサンプル位置を表すポイントのOGRシェープファイルがあります。

私はこれらのポイントの下のピクセルでいくつかの分析を実行しようとしていますが、そうするには、ポイントの下のピクセルの値を抽出できる必要があります。

PythonでOGRとGDALのみを使用して、ポイントの下のピクセルの値を抽出することは可能ですか？ReadAsArray()出力ラスターは非常に大きい（メモリに収まるには大きすぎる）ため、ラスター全体をを介してメモリに読み込むことは避けたいと思います。

私はこの投稿に気づきましたが、これは似ていますが、コマンドライン呼び出しが必要です。

gdal.Datasetまたはgdal.Band ReadRasterメソッドを使用できます。参照GDALとOGR APIのチュートリアルと、以下の例を。ReadRasterはnumpyを使用/要求しません。戻り値は生のバイナリデータであり、標準のpython structモジュールを使用して解凍する必要があります。

例：

from osgeo import gdal,ogr
import struct

src_filename = '/tmp/test.tif'
shp_filename = '/tmp/test.shp'

src_ds=gdal.Open(src_filename) 
gt=src_ds.GetGeoTransform()
rb=src_ds.GetRasterBand(1)

ds=ogr.Open(shp_filename)
lyr=ds.GetLayer()
for feat in lyr:
    geom = feat.GetGeometryRef()
    mx,my=geom.GetX(), geom.GetY()  #coord in map units

    #Convert from map to pixel coordinates.
    #Only works for geotransforms with no rotation.
    px = int((mx - gt[0]) / gt[1]) #x pixel
    py = int((my - gt[3]) / gt[5]) #y pixel

    structval=rb.ReadRaster(px,py,1,1,buf_type=gdal.GDT_UInt16) #Assumes 16 bit int aka 'short'
    intval = struct.unpack('h' , structval) #use the 'short' format code (2 bytes) not int (4 bytes)

    print intval[0] #intval is a tuple, length=1 as we only asked for 1 pixel value

また、使用しない理由は、使用時numpyに配列全体を読み取らないようにするためであるためReadAsArray()、以下はnumpyラスター全体を使用し、読み取らない例です。

from osgeo import gdal,ogr
import struct

src_filename = '/tmp/test.tif'
shp_filename = '/tmp/test.shp'

src_ds=gdal.Open(src_filename) 
gt=src_ds.GetGeoTransform()
rb=src_ds.GetRasterBand(1)

ds=ogr.Open(shp_filename)
lyr=ds.GetLayer()
for feat in lyr:
    geom = feat.GetGeometryRef()
    mx,my=geom.GetX(), geom.GetY()  #coord in map units

    #Convert from map to pixel coordinates.
    #Only works for geotransforms with no rotation.
    px = int((mx - gt[0]) / gt[1]) #x pixel
    py = int((my - gt[3]) / gt[5]) #y pixel

    intval=rb.ReadAsArray(px,py,1,1)
    print intval[0] #intval is a numpy array, length=1 as we only asked for 1 pixel value