R gstat krige()-位置[5.88,47.4,0]で特異な共分散行列:スキップ


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データテーブルで使用する値に応じて、クリギングを実行したい場合にのみ機能します。krige関数の結果として、私はのために取得var1.pred: NA NA NA ...し、var1.var: NA NA NA ...(私は私のDataTableの「間違った」値を使用する場合のみです。)

例えば:

  • それが動作します常に(今のところ)私は10個の値を使用する場合
  • 50個の値を使用すると機能しますが、特定の値でのみ機能します
  • 50個の値と「間違った」値を使用すると機能しません
  • 25個の値と前述の「間違った」値を使用すると機能します

なぜ機能しているのか、機能していないのかわかりません。奇妙なことはZwiesel;49.02999878;13.22999954;2.2、データテーブルに追加するときに、20未満の値を使用すると機能するが、50を超える値を使用すると機能しないということです...

私の間違いはどこですか?

myWeatherTable.csv:

Place;Latitude;Longitude;Temperature
Aachen;50.77999878;6.09999990;3
Abbikenhausen;53.52999878;8.00000000;7.9
Adelbach;49.04000092;9.76000023;3.1
Adendorf;51.61999893;11.69999981;1.9
Alberzell;48.45999908;11.34000015;4.6
...
...

クリギング補間を実行するための私のコード

WeatherData <- read.csv(file="myWeatherTable", header = TRUE, sep ";")

coordinates(WeatherData) = ~Longitude + Latitude

vario <-  variogram(log(Temperature) ~1, WeatherData)
vario.fit <- fit.variogram(vario, vgm("Sph"))

min_lon <- min(WeatherData$Longitude)
max_lon <- max(WeatherData$Longitude)
min_lat <- min(WeatherData$Latitude)
max_lat <- max(WeatherData$Latitude)
Longitude.range <- as.numeric(c(min_lon,max_lon))
Latitude.range <- as.numeric(c(min_lat,max_lat))
grd <- expand.grid(Longitude = seq(from = Longitude.range[1], to = Longitude.range[2], by = 0.1),
  Latitude = seq(from = Latitude.range[1],to = Latitude.range[2], by = 0.1))
coordinates(grd) <- ~Longitude + Latitude
gridded(grd) <- TRUE

plot1 <- WU_data_spatial %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points with measurements")

plot2 <- grd %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points at which to estimate")

grid.arrange(plot1, plot2, ncol = 2)

kriged <- krige(Temperature~ 1, WeatherData, grd, model=variogram_fit)

警告

1: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.88,47.4,0]: skipping...
2: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.98,47.4,0]: skipping...
3: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.08,47.4,0]: skipping...
4: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.18,47.4,0]: skipping...
...
...

回答:


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場所が重複しているため、通常、このエラーが返されます。sp::zerodist関数で確認できます。

重複する場所を削除するにsp::zerodistは、ブラケットインデックス内で呼び出します。

WeatherData <- WeatherData[-zerodist(WeatherData)[,1],] 
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