ラスタを多角形に整形する方法

ラスターをポリゴンに変換するオープンソースのPythonソリューションを探しています（ArcPyは使用しません）。

ラスターをポリゴンに変換するGDAL関数を知っていました。これはマニュアルです：http : //pcjericks.github.io/py-gdalogr-cookbook/raster_layers.html#polygonize-a-raster-band

それにもかかわらず、出力はファイルとして保存されず、一時的にメモリ内にある、形の良いポリゴンまたは任意のオブジェクトになる可能性があります。この問題を処理するパッケージまたはコードはありますか？

ラスターがnumpy配列で処理されている場合、アプローチは以下のとおりです。

Sean Gilliesのrasterioを使用します。Fiona（シェープファイルの読み取りと書き込み）と同じ作成者のシェイプリーと簡単に組み合わせることができます。

スクリプトrasterio_polygonize.py の先頭は

import rasterio
from rasterio.features import shapes
mask = None
with rasterio.drivers():
    with rasterio.open('a_raster') as src:
        image = src.read(1) # first band
        results = (
        {'properties': {'raster_val': v}, 'geometry': s}
        for i, (s, v) 
        in enumerate(
            shapes(image, mask=mask, transform=src.affine)))

結果は、GeoJSON機能のジェネレーターです。

 geoms = list(results)
 # first feature
 print geoms[0]
 {'geometry': {'type': 'Polygon', 'coordinates': [[(202086.577, 90534.3504440678), (202086.577, 90498.96207), (202121.96537406777, 90498.96207), (202121.96537406777, 90534.3504440678), (202086.577, 90534.3504440678)]]}, 'properties': {'raster_val': 170.52000427246094}}

きれいな形状に変換できること

from shapely.geometry import shape
print shape(geoms[0]['geometry'])
POLYGON ((202086.577 90534.35044406779, 202086.577 90498.96206999999, 202121.9653740678 90498.96206999999, 202121.9653740678 90534.35044406779, 202086.577 90534.35044406779))

geopandas Dataframeを作成し、空間結合、プロット、geojson、ESRIシェープファイルとして保存などの使いやすい機能を有効にします。

geoms = list(results)
import geopandas as gp
gpd_polygonized_raster  = gp.GeoDataFrame.from_features(geoms)

これが私の実装です。

from osgeo import ogr, gdal, osr
from osgeo.gdalnumeric import *  
from osgeo.gdalconst import * 
import fiona
from shapely.geometry import shape
import rasterio.features

#segimg=glob.glob('Poly.tif')[0]
#src_ds = gdal.Open(segimg, GA_ReadOnly )
#srcband=src_ds.GetRasterBand(1)
#myarray=srcband.ReadAsArray() 
#these lines use gdal to import an image. 'myarray' can be any numpy array

mypoly=[]
for vec in rasterio.features.shapes(myarray):
    mypoly.append(shape(vec))

rasterioをインストールする方法は、インストールの問題がある場合、「conda install -c https://conda.anaconda.org/ioos rasterio」を使用することです。