道路の大きな(〜70MB)シェープファイルがあり、これを各セルの道路密度を持つラスターに変換したい。理想的には、必要に応じてGDALコマンドラインツールとともにRでこれを実行したいと思います。
私の最初のアプローチは、このスレッドごとに各セルの線分セグメントの長さを直接計算することでした。これにより目的の結果が得られますが、シェープファイルが私のものよりはるかに小さい場合でも非常に遅くなります。正しいセル値が明らかな非常に単純化された例は次のとおりです。
require(sp)
require(raster)
require(rgeos)
require(RColorBrewer)
# Create some sample lines
l1 <- Lines(Line(cbind(c(0,1),c(.25,0.25))), ID="a")
l2 <- Lines(Line(cbind(c(0.25,0.25),c(0,1))), ID="b")
sl <- SpatialLines(list(l1,l2))
# Function to calculate lengths of lines in given raster cell
lengthInCell <- function(i, r, l) {
r[i] <- 1
rpoly <- rasterToPolygons(r, na.rm=T)
lc <- crop(l, rpoly)
if (!is.null(lc)) {
return(gLength(lc))
} else {
return(0)
}
}
# Make template
rLength <- raster(extent(sl), res=0.5)
# Calculate lengths
lengths <- sapply(1:ncell(rLength), lengthInCell, rLength, sl)
rLength[] <- lengths
# Plot results
spplot(rLength, scales = list(draw=TRUE), xlab="x", ylab="y",
col.regions=colorRampPalette(brewer.pal(9, "YlOrRd")),
sp.layout=list("sp.lines", sl),
par.settings=list(fontsize=list(text=15)))
round(as.matrix(rLength),3)
#### Results
[,1] [,2]
[1,] 0.5 0.0
[2,] 1.0 0.5
良さそうに見えますが、スケーラブルではありません!他のいくつかの質問ではspatstat::density.psp()
、このタスクにこの機能が推奨されています。この関数は、カーネル密度アプローチを使用します。私はそれを実装することができ、上記のアプローチよりも高速に見えますが、パラメータの選択方法や結果の解釈方法がわかりません。を使用した上記の例は次のとおりですdensity.psp()
。
require(spatstat)
require(maptools)
# Convert SpatialLines to psp object using maptools library
pspSl <- as.psp(sl)
# Kernel density, sigma chosen more or less arbitrarily
d <- density(pspSl, sigma=0.01, eps=0.5)
# Convert to raster
rKernDensity <- raster(d)
# Values:
round(as.matrix(rKernDensity),3)
#### Results
[,1] [,2]
[1,] 0.100 0.0
[2,] 0.201 0.1
セルごとの長さではなく、密度を計算するのはカーネルアプローチであると考えたので、変換しました。
# Convert from density to length per cell for comparison
rKernLength <- rKernDensity * res(rKernDensity)[1] * res(rKernDensity)[2]
round(as.matrix(rKernLength),3)
#### Results
[,1] [,2]
[1,] 0.025 0.000
[2,] 0.050 0.025
ただし、どちらの場合も、カーネルアプローチは上記のより直接的なアプローチとほぼ一致します。
だから、私の質問は次のとおりです。
density.psp
関数の出力をどのように解釈できますか?単位は何ですか?- 上記のより直接的で直感的なアプローチと結果が一致するように、どのように
sigma
パラメーターを選択できますdensity.psp
か? - おまけ:カーネルの線密度は実際には何ですか?これらのアプローチがポイントに対してどのように機能するかについてある程度の感覚はありますが、それが線にどのように拡張されるかはわかりません。