QGIS Desktop(2.7.0)のトップレベルメニューに新しいメニュー項目を追加する必要があります。つまり、「プロジェクト」、「編集」、「表示」、「レイヤー」などと同じレベルになります。
私が知っている限り、QgisInterface(http://qgis.org/api/classQgisInterface.html)を使用してメニュー項目を非表示にする方法(設定->カスタマイズ)があり、QGISで既に定義されているメニューに新しい項目を追加できます(プラグインコードからaddLayerMenu、addPluginToDatabaseMenuなど)。
しかし、最上層に新しいメニュー項目が必要です(これは顧客の要求です)。