これにはいくつかの回避策があることは知っていますが、直接的な解決策が存在することを望んでいました。
編集したファイルを保存/エクスポートするときにジオリファレンス情報を削除せずにGeoTIFFを編集するために使用できる画像エディター(Photoshopのようにできればフリーソフトウェア)を探しています。この問題を回避するために.TFWファイルを作成できることはわかっていますが、追加のファイルを作成したくないので、それらをGeoTIFF(ジオリファレンス情報が埋め込まれた.TIFF画像)として保持したいと考えています。
GIMP、PhotoFiltre、LazPaint、Paint.NETを試しましたが、編集した画像を保存するときにTIFFの地理参照データは保存されません。