Rでラスターをモザイク化しますか？

Rで複数のラスタを単一の大きなラスタにモザイク化しようとしています。https：//stackoverflow.com/questions/15287807/how-can-i-create-raster-mosaic-using-list-of-rastersに投稿されているスクリプトを使用しています。 しかし、警告メッセージとエラーメッセージが表示されます。

rasters1 <- list.files("F:\\MOD15A2_LAI_1km\\MOD15A2_LAI_2009", 
                      pattern = "mod15a2.a2009001.*.005.*.img$", 
                      full.names = TRUE, recursive = TRUE)

mos1 <-mosaic(rasters1, fun=mean)

以下のようにエラーを報告していました

Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘extent’ for signature ‘"character"’

次に、別のバージョンを試しました。

rasters1.mosaicargs <- rasters1
rasters1.mosaicargs$fun <- mean

しかし、ここに以下のようないくつかの警告メッセージ

Warning message:
In rasters1.mosaicargs$fun <- mean : Coercing LHS to a list

メッセージを無視して続行しました

mos2 <- do.call(mosaic, rasters1.mosaicargs)

しかし、ここで上記と同じエラー

Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘mosaic’ for signature ‘"character", "character"’

ここでの問題は、mosaicとdo.callがリスト内のラスターオブジェクトを想定していることであり、「rasters1」ベクターに含まれているラスターの文字名だけではありません。実際には、ラスターオブジェクトではなく、ベクトルで名前をモザイク化するように求めています。

# Create some example data
require(raster)
    r <- raster(ncol=100, nrow=100)
      r1 <- crop(r, extent(-10, 11, -10, 11))
        r1[] <- 1:ncell(r1)
          r2 <- crop(r, extent(0, 20, 0, 20))
          r2[] <- 1:ncell(r2)
      r3 <- crop(r, extent(9, 30, 9, 30))
    r3[] <- 1:ncell(r3)

# If I create a list object of the raster names, as your are doing with list.files, 
#    do.call will fail with a character signature error 
rast.list <- list("r1","r2","r3")   
  rast.list$fun <- mean     
    rast.mosaic <- do.call(mosaic,rast.list)

# However, if I create a list contaning raster objects, the do.call function 
#   will work when mosaic is passed to it.      
rast.list <- list(r1, r2, r3)     
  rast.list$fun <- mean
    rast.mosaic <- do.call(mosaic,rast.list)
      plot(rast.mosaic)

# You could specify a for loop to create a list object, 
#   contaning raster objects
rasters1 <- list.files("F:/MOD15A2_LAI_1km/MOD15A2_LAI_2009", 
                       pattern="mod15a2.a2009001.*.005.*.img$", 
                       full.names=TRUE, recursive=TRUE)
rast.list <- list()
  for(i in 1:length(rasters1)) { rast.list[i] <- raster(rasters1[i]) }

# And then use do.call on the list of raster objects
rast.list$fun <- mean
  rast.mosaic <- do.call(mosaic,rast.list)
    plot(rast.mosaic)

テーマのわずかなバリエーション。空のリストとforループの作成を回避できます ...

    rast.list <- list()

    for(i in 1:length(rasters1)) { 
rast.list[i] <- raster(rasters1[i])
}

... lapplyコマンドを使用します。

    rast.list <- lapply(1:length(rasters1),
 function(x) {
raster(rasters1[x])
})