Noah Stahlのブログには、Timer2でLEDを点滅させる例があります。それとデータシートを使用して、使用したい割り込み（つまり、通常の機能を放棄する余裕がある、または変更したい割り込み）にそれを適合させることができるはずです。Timer2は通常、一部のPWM機能に使用されます。
彼の例はATmega2560を引用しています。ATmega328pでも動作することを確認できました。より有用なArduino割り込みの例については、彼のサイトを見てください。
編集：
これは、わずかに編集された（主にコメントの）バージョンのNoahのコードです。関連するデータ構造またはハードウェアを初期化した後、Arduinoのsetup（）関数からTimer2init（）を呼び出します。これを行うと、タイミングと割り込みが開始されるためです。
F / ex、3桁の7セグメントディスプレイを多重化するために使用したので、タイマーを初期化する前に、ディスプレイI / Oレジスタを初期化し、ISRが検索する場所のディスプレイデータをブランクにしました。
データシートのいくつかの有用なタイミングデータと、別のタイミングスキームを設定するための参照用の独自の計算のコメントに表があります。
ISR（）マクロは、通常の関数の入り口と出口の代わりにISRの割り込み入り口コードと出口コードを作成し、それを適切な割り込みベクトルにリンクします。その関数の残りの部分は、1）各割り込みで実行されるコード、および2）次の割り込みのタイマーをリセットするコードコードです。
書かれているように、これは.pdeまたは.inoスケッチ（またはeclipse、f / exを使用する場合は.cppファイル）にドロップする必要があります。スケッチはLEDPINを#defineする必要があり、setup（）はTimer2init（）を呼び出す必要があります。ループ関数は空かそうでないかもしれません。ダウンロード時にLEDが点滅し始めます（まあ、文字通り、Timer2init（）が呼び出された後）。
/*
* From sample interrupt code published by Noah Stahl on his blog, at:
* http://arduinomega.blogspot.com/p/arduino-code.html
*
*/
/*** FUNC
Name: Timer2init
Function: Init timer 2 to interrupt periodically. Call this from
the Arduino setup() function.
Description: The pre-scaler and the timer count divide the timer-counter
clock frequency to give a timer overflow interrupt rate:
Interrupt rate = 16MHz / (prescaler * (255 - TCNT2))
TCCR2B[b2:0] Prescaler Freq [KHz], Period [usec] after prescale
0x0 (TC stopped) 0 0
0x1 1 16000. 0.0625
0x2 8 2000. 0.500
0x3 32 500. 2.000
0x4 64 250. 4.000
0x5 128 125. 8.000
0x6 256 62.5 16.000
0x7 1024 15.625 64.000
Parameters: void
Returns: void
FUNC ***/
void Timer2init() {
// Setup Timer2 overflow to fire every 8ms (125Hz)
// period [sec] = (1 / f_clock [sec]) * prescale * (255-count)
// (1/16000000) * 1024 * (255-130) = .008 sec
TCCR2B = 0x00; // Disable Timer2 while we set it up
TCNT2 = 130; // Reset Timer Count (255-130) = execute ev 125-th T/C clock
TIFR2 = 0x00; // Timer2 INT Flag Reg: Clear Timer Overflow Flag
TIMSK2 = 0x01; // Timer2 INT Reg: Timer2 Overflow Interrupt Enable
TCCR2A = 0x00; // Timer2 Control Reg A: Wave Gen Mode normal
TCCR2B = 0x07; // Timer2 Control Reg B: Timer Prescaler set to 1024
}
/*** FUNC
Name: Timer2 ISR
Function: Handles the Timer2-overflow interrupt
Description: Maintains the 7-segment display
Parameters: void
Returns: void
FUNC ***/
ISR(TIMER2_OVF_vect) {
static unsigned int led_state = 0; // LED state
led_state = !led_state; // toggles the LED state
digitalWrite(TOGGLE_PIN, led_state);
TCNT2 = 130; // reset timer ct to 130 out of 255
TIFR2 = 0x00; // timer2 int flag reg: clear timer overflow flag
};