回答:
私はこれを使っています:
$payment = commerce_payment_method_instance_load('foo|commerce_payment_foo');
どこfooのお支払い方法の文字列識別子です。
結果の配列には'settings'インデックスが含まれ、データは設定フォームに保存されます。
つまりfoo|commerce_payment_foo、構成するインスタンスID method_id|rule_nameです。
をmethod_id実行するcommerce_payment_methods()とrule_name見つかり、支払いアクションの編集時にURLに表示されます(で/admin/commerce/config/payment-methods)。