クエリを再現するために必要なデータベースのサブセットをmysqldumpすることは可能ですか？

バックグラウンド

selectクエリを再現するために必要なデータベースのサブセットを提供したいと思います。私の目標は、計算ワークフローを再現可能にすることです（再現可能な研究のように）。

質問

このselectステートメントを、クエリされたデータを新しいデータベースにダンプするスクリプトに組み込んで、データベースを新しいmysqlサーバーにインストールし、ステートメントが新しいデータベースで機能するようにする方法はありますか。新しいデータベースには、クエリで使用されたレコードに加えてレコードを含めるべきではありません。

更新： 明確にするために、クエリ結果のcsvダンプには興味がありません。私ができる必要があるのは、データベースのサブセットをダンプして、別のマシンにインストールできるようにすることです。そうすれば、クエリ自体を再現可能にすることができます（同じデータセットに関して変更可能です）。

例

たとえば、私の分析では、複数の（この例では3つの）テーブルからのレコードを必要とするデータのサブセットを照会します。

select table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

mysqldumpには、特定のテーブルに対してWHERE句を実行する--whereオプションがあります。

結合クエリをmysqldumpすることはできませんが、各テーブルからフェッチされたすべての行が後で結合に関与するように、各テーブルから特定の行をエクスポートできます。

指定したクエリに対して、mysqldumpを3回実行する必要があります。

最初に、名前が（ 'fee'、 'fi'、 'fo'、 'fum'）のすべてのtable3行をmysqldumpします。

mysqldump -u... -p... --where="name in ('fee','fi','fo','fum')" mydb table3 > table3.sql

次に、最初のmysqldumpのtable3_id値が一致するすべてのtable2行をmysqldumpします。

mysqldump -u... -p... --lock-all-tables --where="table3_id in (select id from table3 where name in ('fee','fi','fo','fum'))" mydb table2 > table2.sql

次に、2番目のmysqldumpから一致するtable1_id値を持つすべてのtable1行をmysqldumpします。

mysqldump -u... -p... --lock-all-tables --where="id in (select table1_id from table2 where table3_id in (select id from table3 where name in ('fee','fi','fo','fum')))" mydb table1 > table1.sql

注：2番目と3番目のmysqldumpでは複数のテーブルを使用する必要があるため、--lock-all-tablesを使用する必要があります。

新しいデータベースを作成します。

mysqladmin -u... -p... mysqladmin create newdb

最後に、3つのmysqldumpsを別のデータベースにロードし、新しいデータベースでそこで結合を試みます。

mysql -u... -p... -D newdb < table1.sql
mysql -u... -p... -D newdb < table2.sql
mysql -u... -p... -D newdb < table3.sql

mysqlクライアントで、結合クエリを実行します

mysql> use newdb
mysql> select table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

試してみる ！！！

警告：正しくインデックス付けされていない場合、2番目と3番目のmysqldumpが永遠にかかることがあります!!!

念のため、次の列にインデックスを付けます。

ALTER TABLE table2 ADD INDEX (table1_id);
ALTER TABLE table2 ADD INDEX (table3_id);
ALTER TABLE table3 ADD INDEX (name,id);

idはtable3の主キーであると仮定します。

この問題を解決するには、mysqldumpの代わりにSELECTの一部として「outfile」を使用することを検討します。必要なSELECTステートメントを作成し、最後に「INTO OUTFILE '/path/to/outfile.csv' ...」をCSVスタイル出力の適切な構成とともに追加できます。次に、 ' LOAD DATA INFILE ...'構文のようなものを使用して、新しいスキーマの場所にデータをロードします。

たとえば、SQLを使用する場合：

select table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum')
INTO OUTFILE '/tmp/fee-fi-fo-fum.csv'
FIELDS TERMINATED BY ',' OPTIONALLY ENCLOSED BY '"'
LINES TERMINATED BY '\n'
; 

ターゲットディスクパーティションに十分な空き容量が必要になることに注意してください。

mysqldump utilには、ダンプするテーブルを指定できる--tablesオプションがあります。テーブルのリストを指定できます。

簡単な（自動化された）方法がわかりません。

私にとって有用だったのは次のようなものでした：

mysqldump -u db_user -p db_name table_name --no_create_info \
--lock-all-tables --where 'id in (SELECT tn.id FROM table_name AS tn \
JOIN related_table AS rt ON tn.related_table_id = rt.id \
WHERE rt.some_field = 1)' > data.sql

http://krosinski.blogspot.com/2012/12/using-table-join-with-mysqldump.htmlから

mysqlでquote関数を試しましたか？

SELECT CONCAT("insert into table4(id,level,name,levelt2) VALUES(",   quote(table1.id),   ",",    quote(table1.level),   ",",    quote(table2.name),   ",",    quote(table2.level),    ");") as q
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

上記をquery.sqlとして保存します

cat query.sql|mysql --skip-column-names --raw > table4.sql

MySQLの場合：

SHOW CREATE TABLE table1; -- use these two create statements
SHOW CREATE TABLE table2; -- to design table4's create statement
CREATE TABLE table4( .... );
INSERT INTO table4(id,level,name,levelt2)
SELECT table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
   from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
   join table3 on table3.id = table2.table3_id
   where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

コマンドラインで：

mysqldump mydb table4 |gzip > table4.sql.gz

移行先サーバーで、〜/ .my.cnfをセットアップします

[client]
default-character-set=utf8

移行先サーバーにインポートする

zcat table4.sql.gz | mysql

私は同様の問題のための小さなスクリプトを書いた、ここにある：https : //github.com/digitalist/mysql_slice

include ('queryDumper.php');


$exampleQuery="select * from information_schema.columns c1 
left join information_schema.columns c2 on 1=1 limit 1";

//define credentials
$exampleMysqli = new mysqli($host, $user, $password, $database);
$exampleResult=$exampleMysqli->query($exampleQuery);

//if  mysqlnd (native driver installed), otherwise use wrapper
$exampleData=fetchAll($exampleResult);
$exampleMeta=$exampleResult->fetch_fields();

/*
 * field content removal options
 * column name => function name in queryDumper.php, namespace QueryDumperHelpers
 * 
 * */

$forbiddenFields=array(
'password'=>'replacePassword', //change password -> md5("password")
'login'=>'replaceLogin', //change login vasya@mail.ru -> vasya@example.com
'comment'=>'sanitizeComment' //lorem ipsum or 
);


//get tables dump
$dump=(\queryDumper\dump($exampleData, $exampleMeta, $forbiddenFields));



$dropDatabase=true; //default false
$dropTable=true; //default false

$dbAndTablesCreationDump=\QueryDumperDatabaseAndTables\dump($exampleMysqli,$exampleMeta, $dropDatabase, $dropTable);

$databases=$dbAndTablesCreationDump['databases'];
$tables=$dbAndTablesCreationDump['tables'];
$eol=";\n\n";
echo implode($eol, $databases)."\n";
echo implode($eol, $tables).";\n";
echo "\n";

//consider using array_unique($dump) before imploding
echo implode("\n\n", $dump);
echo "\n";
?>

すなわち、あなたはこのクエリを持っています：

SELECT * FROM employees.employees e1 
LEFT JOIN employees.employees e2 ON 1=1 
LIMIT 1; 

あなたはこのダンプを得ました：

DROP DATABASE `employees`;

CREATE DATABASE `employees`;
CREATE TABLE `employees` ( /* creation code */ ) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1;

INSERT IGNORE INTO `employees`.`employees` VALUES ("10001","1953-09-02","Georgi","Facello","M","1986-06-26");

INSERT IGNORE INTO `employees`.`employees` VALUES ("10001","1953-09-02","Georgi","Facello","M","1986-06-26");