少し前に、MySQLデータベースの1つで高いCPUシステム時間を経験し始めました。このデータベースもディスク使用率が高いため、それらが接続されていることがわかりました。また、SSDへの移行をすでに計画していたため、両方の問題を解決できると考えました。
それは役に立ちました...しかし、長くはありませんでした。
これはどこからともなく発生し、負荷やアプリケーションロジックに明らかな変化はありませんでした。
DB統計:
- MySQLバージョン-5.7.20
- OS-Debian
- DBサイズ-1.2Tb
- RAM-700Gb
- CPUコア-56
- ピーク負荷-約5kq / sの読み取り、600q / sの書き込み(選択クエリはしばしばかなり複雑ですが)
- スレッド-50実行、300接続
- 約300のテーブルがあり、すべてInnoDB
MySQL設定:
[client]
port = 3306
socket = /var/run/mysqld/mysqld.sock
[mysqld_safe]
pid-file = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket = /var/run/mysqld/mysqld.sock
nice = 0
[mysqld]
user = mysql
pid-file = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket = /var/run/mysqld/mysqld.sock
port = 3306
basedir = /usr
datadir = /opt/mysql-data
tmpdir = /tmp
lc-messages-dir = /usr/share/mysql
explicit_defaults_for_timestamp
sql_mode = STRICT_TRANS_TABLES,NO_ZERO_IN_DATE,NO_ZERO_DATE,ERROR_FOR_DIVISION_BY_ZERO,NO_AUTO_CREATE_USER,NO_ENGINE_SUBSTITUTION
log-error = /opt/mysql-log/error.log
# Replication
server-id = 76
gtid-mode = ON
enforce-gtid-consistency = true
relay-log = /opt/mysql-log/mysql-relay-bin
relay-log-index = /opt/mysql-log/mysql-relay-bin.index
replicate-wild-do-table = dbname.%
log-bin = /opt/mysql-log/mysql-bin.log
expire_logs_days = 7
max_binlog_size = 1024M
binlog-format = ROW
log-bin-trust-function-creators = 1
log_slave_updates = 1
# Disabling symbolic-links is recommended to prevent assorted security risks
symbolic-links=0
# * IMPORTANT: Additional settings that can override those from this file!
# The files must end with '.cnf', otherwise they'll be ignored.
#
!includedir /etc/mysql/conf.d/
# Here goes
skip_name_resolve = 1
general_log = 0
slow_query_log = 1
slow_query_log_file = /opt/mysql-log/slow.log
long_query_time = 3
max_allowed_packet = 16M
max_connections = 700
max_execution_time = 200000
open_files_limit = 32000
table_open_cache = 8000
thread_cache_size = 128
innodb_buffer_pool_size = 550G
innodb_buffer_pool_instances = 28
innodb_log_file_size = 15G
innodb_log_files_in_group = 2
innodb_flush_method = O_DIRECT
max_heap_table_size = 16M
tmp_table_size = 128M
join_buffer_size = 1M
sort_buffer_size = 2M
innodb_lru_scan_depth = 256
query_cache_type = 0
query_cache_size = 0
innodb_temp_data_file_path = ibtmp1:12M:autoextend:max:30G
その他の観察
ピーク負荷時のmysqlプロセスのパフォーマンス:
68,31% 68,31% mysqld [kernel.kallsyms] [k] _raw_spin_lock
- _raw_spin_lock
+ 51,63% 0x7fd118e9dbd9
+ 48,37% 0x7fd118e9dbab
+ 37,36% 0,02% mysqld libc-2.19.so [.] 0x00000000000f4bd9
+ 33,83% 0,01% mysqld libc-2.19.so [.] 0x00000000000f4bab
+ 26,92% 0,00% mysqld libpthread-2.19.so [.] start_thread
+ 26,82% 0,00% mysqld mysqld [.] pfs_spawn_thread
+ 26,82% 0,00% mysqld mysqld [.] handle_connection
+ 26,81% 0,01% mysqld mysqld [.] do_command(THD*)
+ 26,65% 0,02% mysqld mysqld [.] dispatch_command(THD*, COM_DATA const*, enum_server_command)
+ 26,29% 0,01% mysqld mysqld [.] mysql_parse(THD*, Parser_state*)
+ 24,85% 0,01% mysqld mysqld [.] mysql_execute_command(THD*, bool)
+ 23,61% 0,00% mysqld mysqld [.] handle_query(THD*, LEX*, Query_result*, unsigned long long, unsigned long long)
+ 23,54% 0,00% mysqld mysqld [.] 0x0000000000374103
+ 19,78% 0,00% mysqld mysqld [.] JOIN::exec()
+ 19,13% 0,15% mysqld mysqld [.] sub_select(JOIN*, QEP_TAB*, bool)
+ 13,86% 1,48% mysqld mysqld [.] row_search_mvcc(unsigned char*, page_cur_mode_t, row_prebuilt_t*, unsigned long, unsigned long)
+ 8,48% 0,25% mysqld mysqld [.] ha_innobase::general_fetch(unsigned char*, unsigned int, unsigned int)
+ 7,93% 0,00% mysqld [unknown] [.] 0x00007f40c4d7a6f8
+ 7,57% 0,00% mysqld mysqld [.] 0x0000000000828f74
+ 7,25% 0,11% mysqld mysqld [.] handler::ha_index_next_same(unsigned char*, unsigned char const*, unsigned int)
これは、mysqlがspin_locksに多くの時間を費やしていることを示しています。残念ながら運が悪いのに、これらのロックがどこから来ているのかを知る手がかりが欲しいと思っていました。
高負荷時のクエリプロファイルは、極端な量のコンテキスト切り替えを示します。私はselect * from MyTableを使用しました。ここで、pk = 123、MyTableには約9千万の行があります。プロファイル出力:
Status Duration CPU_user CPU_system Context_voluntary Context_involuntary Block_ops_in Block_ops_out Messages_sent Messages_received Page_faults_major Page_faults_minor Swaps Source_function Source_file Source_line
starting 0,000756 0,028000 0,012000 81 1 0 0 0 0 0 0 0
checking permissions 0,000057 0,004000 0,000000 4 0 0 0 0 0 0 0 0 check_access sql_authorization.cc 810
Opening tables 0,000285 0,008000 0,004000 31 0 0 40 0 0 0 0 0 open_tables sql_base.cc 5650
init 0,000304 0,012000 0,004000 31 1 0 0 0 0 0 0 0 handle_query sql_select.cc 121
System lock 0,000303 0,012000 0,004000 33 0 0 0 0 0 0 0 0 mysql_lock_tables lock.cc 323
optimizing 0,000196 0,008000 0,004000 20 0 0 0 0 0 0 0 0 optimize sql_optimizer.cc 151
statistics 0,000885 0,036000 0,012000 99 6 0 0 0 0 0 0 0 optimize sql_optimizer.cc 367
preparing 0,000794 0,000000 0,096000 76 2 32 8 0 0 0 0 0 optimize sql_optimizer.cc 475
executing 0,000067 0,000000 0,000000 10 1 0 0 0 0 0 0 0 exec sql_executor.cc 119
Sending data 0,000469 0,000000 0,000000 54 1 32 0 0 0 0 0 0 exec sql_executor.cc 195
end 0,000609 0,000000 0,016000 64 4 0 0 0 0 0 0 0 handle_query sql_select.cc 199
query end 0,000063 0,000000 0,000000 3 1 0 0 0 0 0 0 0 mysql_execute_command sql_parse.cc 4968
closing tables 0,000156 0,000000 0,000000 20 4 0 0 0 0 0 0 0 mysql_execute_command sql_parse.cc 5020
freeing items 0,000071 0,000000 0,004000 7 1 0 0 0 0 0 0 0 mysql_parse sql_parse.cc 5596
cleaning up 0,000533 0,024000 0,008000 62 0 0 0 0 0 0 0 0 dispatch_command sql_parse.cc 1902
Peter Zaitsevは最近コンテキストスイッチについて投稿しました。
ただし、現実の世界では、クエリごとのコンテキストスイッチが10未満であれば、競合が大きな問題になることを心配する必要はありません。
しかし、600を超えるスイッチが表示されます。
何がこれらの症状を引き起こし、それに対して何ができるのでしょうか?私はこの問題に関するポインタや情報に感謝します。これまでに出くわしたすべてはかなり古く、そして/または決定的ではありません。
PS必要に応じて、追加情報を喜んで提供します。
SHOW GLOBAL STATUSおよびSHOW VARIABLESの出力
投稿サイズ制限を超えているため、こちらに投稿できません。
iostat
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
7,35 0,00 5,44 0,20 0,00 87,01
Device: rrqm/s wrqm/s r/s w/s rkB/s wkB/s avgrq-sz avgqu-sz await r_await w_await svctm %util
fd0 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 8,00 0,00 32,00 32,00 0,00 32,00 0,00
sda 0,04 2,27 0,13 0,96 0,86 46,52 87,05 0,00 2,52 0,41 2,80 0,28 0,03
sdb 0,21 232,57 30,86 482,91 503,42 7769,88 32,21 0,34 0,67 0,83 0,66 0,34 17,50
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
9,98 0,00 77,52 0,46 0,00 12,04
Device: rrqm/s wrqm/s r/s w/s rkB/s wkB/s avgrq-sz avgqu-sz await r_await w_await svctm %util
fd0 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00
sda 0,00 1,60 0,00 0,60 0,00 8,80 29,33 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00
sdb 0,00 566,40 55,60 981,60 889,60 16173,60 32,90 0,84 0,81 0,76 0,81 0,51 53,28
avg-cpu: %user %nice %system %iowait %steal %idle
11,83 0,00 72,72 0,35 0,00 15,10
Device: rrqm/s wrqm/s r/s w/s rkB/s wkB/s avgrq-sz avgqu-sz await r_await w_await svctm %util
fd0 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00
sda 0,00 2,60 0,00 0,40 0,00 12,00 60,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00
sdb 0,00 565,20 51,60 962,80 825,60 15569,60 32,32 0,85 0,84 0,98 0,83 0,54 54,56
2018-03-15の更新
> show global status like 'uptime%'
Uptime;720899
Uptime_since_flush_status;720899
> show global status like '%rollback'
Com_rollback;351422
Com_xa_rollback;0
Handler_rollback;371088
Handler_savepoint_rollback;0
global status
CPU使用率の増加と相関関係があるかどうかを監視する計画です。現時点で入手可能なデータで何かが達成できるとは思いません。何か新しいことを見つけたら、別の質問をします。
select * from MyTable where pk = 123
平均してどれくらいの時間がかかりますか?