回答:
ソース管理の統合は、SQL Server 2016の非推奨のデータベースエンジン機能に従ってManagement Studioで非推奨になっていますが、2016で機能しない理由は説明されていません。必要に応じて、この接続項目に投票することをお勧めします。
これは、SSMS 2016（Visual Studio 2015シェル）がロードするパッケージを変更することで有効にできます。Ken Van Hyning（エンジニアリングマネージャー、SQL Serverクライアントツール）によるSQL Server Management Studio（SSMS）のソース管理を参照してください。
コンピューターにパッケージをインストールするには、Visual Studio 2015をインストールする必要があります（無料のCommunity Editionで実行できます）。次に、C:\Program Files (x86)\Microsoft SQL Server\130\Tools\Binn\ManagementStudio\ssms.pkgundefに関連する行を削除（またはコメントアウト）するように変更しTFS SCC Configurationます。
すべてのSSMSの更新（ご存知のようにかなり頻繁に行われます）では、それらの変更を再適用する必要があることに注意してください。
このプロセスをPowerShellスクリプトファイルに入れました。PowerShellギャラリーに公開しようとしていますが、それまではGitHubから取得できます。
SSMS 17でも同じ問題が発生し、同じソリューションが存在します（$SsmsUndefPathパスの130から140に更新する必要があります）。
更新 Azure Data Studioは、ソース管理用の拡張機能を提供します。Azure Data Studioとは