N10
これはナップザックの問題に非常によく似ています!クラスターのサイズは「重み」であり、クラスター内の正のサンプルの数は「値」であり、固定容量のナップサックをできるだけ多くの値で満たしたいと考えています。
ナップザック問題には、正確な解を見つけるためのいくつかのアルゴリズムがあります(動的プログラミングなど)。しかし、便利な貪欲な解決策は、クラスターを降順でソートすることですvalueweightkk0N
1k−1p∈[0,1]k
Pythonの例を次に示します。
import numpy as np
from itertools import combinations, chain
import matplotlib.pyplot as plt
np.random.seed(1)
n_obs = 1000
n = 10
# generate clusters as indices of tree leaves
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.model_selection import cross_val_predict
X, target = make_classification(n_samples=n_obs)
raw_clusters = DecisionTreeClassifier(max_leaf_nodes=n).fit(X, target).apply(X)
recoding = {x:i for i, x in enumerate(np.unique(raw_clusters))}
clusters = np.array([recoding[x] for x in raw_clusters])
def powerset(xs):
""" Get set of all subsets """
return chain.from_iterable(combinations(xs,n) for n in range(len(xs)+1))
def subset_to_metrics(subset, clusters, target):
""" Calculate TPR and FPR for a subset of clusters """
prediction = np.zeros(n_obs)
prediction[np.isin(clusters, subset)] = 1
tpr = sum(target*prediction) / sum(target) if sum(target) > 0 else 1
fpr = sum((1-target)*prediction) / sum(1-target) if sum(1-target) > 0 else 1
return fpr, tpr
# evaluate all subsets
all_tpr = []
all_fpr = []
for subset in powerset(range(n)):
tpr, fpr = subset_to_metrics(subset, clusters, target)
all_tpr.append(tpr)
all_fpr.append(fpr)
# evaluate only the upper bound, using knapsack greedy solution
ratios = [target[clusters==i].mean() for i in range(n)]
order = np.argsort(ratios)[::-1]
new_tpr = []
new_fpr = []
for i in range(n):
subset = order[0:(i+1)]
tpr, fpr = subset_to_metrics(subset, clusters, target)
new_tpr.append(tpr)
new_fpr.append(fpr)
plt.figure(figsize=(5,5))
plt.scatter(all_tpr, all_fpr, s=3)
plt.plot(new_tpr, new_fpr, c='red', lw=1)
plt.xlabel('TPR')
plt.ylabel('FPR')
plt.title('All and Pareto-optimal subsets')
plt.show();
このコードはあなたのために素晴らしい絵を描きます:
210
そして今、ちょっとした塩:サブセットについて全く気にする必要はありませんでした!私がやったのは、それぞれの陽性サンプルの割合で木の葉をソートすることです。しかし、得られたのは、ツリーの確率的予測のROC曲線です。これは、トレーニングセットのターゲット周波数に基づいて葉を手摘みしてツリーを上回ることはできないことを意味します。
リラックスして、通常の確率的予測を使用し続けることができます:)