回答:
コミュニティへようこそ!次のコードでコードを置き換えることができます。
double[] prediction=classifier.distributionForInstance(instance);
    for (int k<prediction.length; k++){
    System.out.println("Probability of class "+
      trains.classAttribute().value(k)+
       " : "+Double.toString(prediction[k]));
      }
このループは、4つの値すべてを出力します。
それがあなたを助けることを願っています。
それはうまくいきます、ありがとうございます。いくつかの修正があります:
    //Dont forget create new Instance for prediction.
    DenseInstance newinstance = new DenseInstance(2);
    double[] prediction=classifier.distributionForInstance(newinstance);
    //Some correction in for 
        for (int k =0; k<prediction.length; k++){
            System.out.println("Probability of class "+
                    newinstance.classAttribute().value(k)+
                    " : "+Double.toString(prediction[k]));
        }