iTunes 12.7がiOSアプリを管理しなくなったので、MacからIPAファイルを削除できますか？

新しいiTunes（12.7）はアプリを管理しません。これはデバイス自体（この場合は私のiPhone）から行う必要があります。

MacBook HDからすべてのIPAファイルを削除できますか？

はい。iTunesライブラリのMobile Applicationsフォルダーからアプリを削除できます。TransferPurchasesはアプリを再ダウンロードしなくなります。ただし、アプリをApp Storeの購入済みリストから削除した場合、IPAが将来アプリを再インストールする唯一の方法になります。

iTunesがダウンロードに使用したIPAは、すべてのアプリを含むアプリの特別なバージョンだったため、これは後悔の原因となる可能性があります。最近のストアのほとんどのアプリは薄くなっています。iPhoneでアプリをダウンロードすると、たとえばiPadでのみ必要な部分をスキップする薄いバージョンです。

IPA全体のバックアップコピーと12.7より前のiTunesのコピーを保存しないと、完全なイメージから再インストールできなくなります。

選択したアプリが変更されない場合、またはオンラインApp Storeから削除されない場合、これはそれほど問題にはなりません。ハードウェアを頻繁にアップグレードする場合も、これはそれほど問題にはなりません。サポートされていない古いハードウェアや放棄されたアプリ、または古いバージョンのアプリの実行に関心がある人にとって、これは重大な問題になる可能性があります。